o型口蹄疫病毒苗株p3基因的克隆与序列分析.pdf

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o型口蹄疫病毒苗株p3基因的克隆与序列分析

摘 要 段,然后进行克隆和测序。用DNAStar软件对测定的核苷酸序列进行拼接,获得包 P3编码区核苷酸和氨基酸同源性分别在94.8%~ 与参考序列Chu—Pei、Yunlin/97 BOV、 P3编码区核苷 酸同源性在84.7%~86.9%之间,氨基酸同源性在92.0%~93.9%之间。在各基因中, 3A基因突变率最高。3B、3C和3D基因突变率低,序列比较保守,这与各自的功能 有一定的关系。P3编码区内A-G和C-T的转换率较高,是点突变的热点核苷酸,是 影响氨基酸稳定因素之一。 关键词:口蹄疫病毒;P3基因;克隆;序列分析 and ofP3GeneVaccine CloningSequenceAnalysis StrainOf Foot-·and—-MouthDiseaseViruses0 Type Abstract RNAwasextractedfromvaccinesirainsofFoodandmouth that FMDV/o,NMxw,10/99and were neonate FMDV/O/NMzg/7/99 propagatetby rats.The3ABCand3D一3‘UTR were RT-PCRmethod.then genefragmentsamplifiedby their werecloned inthe fragments and research.Themeterednucleotide sequenced was DNAStar P3whole serieswas sequencesplicingthrough software,the genie the areall 897aa.The andthe3D obtained,andlength 3A,3B,3C 269Int,encoding genes contains and respectively 429,213,639,1410nt,respectivelyencoding143,71,213 470aa.Twostrains3A on276-305beshortofthe30 aminoacids.Thereis genes nt,10 codon融ofthe atthe3D terminate wholeORF termination.TheP3 codingregion nucleotideandamin

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