佛山市南海区散发急性腹泻中诺如病毒毒株型别监测分析.pdfVIP

- 34· 堡童塑堕堕堂 笙 月第34卷笫1期 SouthChina JPreyMed，February 2008，Vol 34，No．1 · 流行病学研究与调查· 佛山市南海区散发急性腹泻中诺如病毒 毒株型别监测分析 曹晓鸥 ，张彦丽 ，陈振明 ，李晖2曾红惠 ，曾鸿 【摘要】目的 了解佛山市南海区内由诺如病毒引起的散发急性胃肠炎中其毒株型别及分布情 况。方法 集中采集2007年4月份南海区内非细茵性腹泻病例标本，采用针对诺如病毒多聚酶核甘 酸序列的特异性引物和逆转录聚合酶链反应(RT—PCR)技术进行诺如病毒检测，筛选由诺如病毒引 起的腹泻标本，并将阳性株的PCR产物送去测序，采用BLAST及序列分析软件分析测序结果推断其 毒株型别。结果 共收集30例非细茵性腹泻标本，病例多为婴幼儿，0～5岁的病例有l7例，占总数的 56．7％，其余病例年龄在17～80岁之间。共检出诺如病毒阳性标本7例，其中婴幼儿4例，成人3例。 测序5例，经用DNAStar软件进行进化树分析属于GⅡ．4型的有4例，是从西樵和黄歧医院收集的腹 泻标本中检测出来的，1例与参考茵株SaitamaU1(AB039775，G1I．12型)系统发生关系接近的茵株来 自平州医院收集的标本。结论 诺如病毒是引起佛山市南海区内散发的病毒性胃肠炎的一种重要的 病原体。检测到的诺如病毒均属于GⅡ型，且以GⅡ-4型为主。未发现G I型的诺如病毒。南海区内可 能存在着不同基因型别的诺如病毒引起的感染。 【关键词】诺如病毒；急性胃肠炎；基因 中图分类号：R373．2 文献标识码：B 文章编号：1671-5039(2008)01—0034—04 2006年底至2007年初，佛山市南海区暴发了2 采集后放于一20~C以下冰箱保存。 起由诺如病毒引起的急性胃肠炎暴发疫隋，为更多的 1．3 标本处理 了解南海区诺如病毒的存在及分布f青况，我们于2007 在含lmL的磷酸盐缓冲液(PBS)或MEM培养 年4月1—30日集中对南海区内的6家镇医院门诊腹 基的2mL血清管中，加入粪便标本制成10％～30％ 泻病例进行了监测，采集非细菌性腹泻病人的标本，检 的悬液，置于漩涡震荡器内混匀 5 min，4℃下≥ 测诺如病毒，分析其存在型别，现将结果报告如下。 5 000 r／min离心5 min，取上清液进行检测。 1．4 诺如病毒检测 1 材料和方法 用A群轮状病毒(胶体金)诊断试剂盒(北京万 泰生物药业有限公司)检测轮状病毒(Rotavirus， 1．1 标本来源 RV)，方法按照试剂盒的说明书进行，RV阴性者用 2007年4月份1—30日收集南海区内6家镇医 RT—PCR的方法检测诺如病毒 (Norovirus，NoV)。 院门诊及住院部非细菌I生胃肠炎病例的粪便标本。 NoV检测参见文献【1】。 1．2 采样要求 1．5 核酸序列测定和分析 根据急性胃肠炎的临床症状和临床检验结果 将收集的NoV阳性标本的PCR结果按照区域 (粪检白细胞阴性，细菌、寄生虫阴性)限定，采集患 选择其中的5份送到上海英俊生物技术有限公司进 者发病3 d内的粪便标本(每份1～5mL)，或患者的 行纯化测序。测序结果用DNAStar软件包进行分 呕吐物(每份 1～5mL)；样品采集表要记录病人的姓