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中医药本体工程研究现状 　　关键词：中医药；本体工程；本体；语义网；综述 　　DOI：10.3969/j.issn.1005-5304.2013.07.051 　　中图分类号：R2-03 文献标识码：A 文章编号：1005-5304（2013）07-0110-03 　　本体（Ontology）是针对领域概念体系的精确规范，用以指明概念的定义以及概念之间的语义关系。它能使交互各方对特定领域内共用的概念、词汇以及概念分类达成一致，支持知识的共享和重用，解决系统之间的互操作问题。近年来，本体工程成为中医药领域广泛关注的研究热点[1]。笔者围绕中医药本体工程，通过查阅近10年相关文献，探讨中医药本体工程的方法、技术、覆盖范围和应用，以期为中医药本体开发人员提供参考。 　　1 概述 　　中医药学历经数千年的发展，形成了一套完整的知识体系。中医药信息学的一个核心任务，是实现中医药知识体系的数字化，从而面向中医团体提供准确、详实的知识服务。中医药知识资源具有鲜明的中国文化特征，包含大量古汉语成分，难以精确描述。现代医学所使用的知识建模方法并不完全适合于中医药领域。因此，迫切需要提出创新的知识建模方法，以支持中医药知识的数字化建设。 　　近年来，学者们开始尝试基于领域本体，研制符合中医药领域特点的知识表达框架，解决中医学知识的获取、分析和推理等问题，包括在国家知识基础设施（National Knowledge Infrastructure，NKI）的建设过程中，构建了中医领域本体，如中医诊断方法、中医术语、中医证候、中医脉象、中医病机等30多个中医本体类，用于实现中医学知识的获取、分析和推理[2-3]。尹氏等[4]针对中医药术语标准化过程中面临的问题，使用本体工程方法，研制了中医药学语言系统（TCMLS）。此外，本体还被用于阴阳理论[5]、五行理论[6]、中医诊断[7]、证候学[8]、 　　基金项目：国家科技重大专项-重大新药创制（2009ZX09301- 005-01）；国家高技术研究发展计划（2006AA01A122）；第52批中国博士后科学基金面上项目（2012M520559）；中国中医科学院基本科研业务费自主选题项目（zz060303） 　　通讯作者：崔蒙，E-mail：cui@mail.cintcm.ac.cn 　　中药学[9]、方剂学[10]、治则治法[11]、针灸学[12]、中医古籍[13]等领域的知识建模和知识获取。这些研究表明，领域本体为中医药知识体系的形式化表达和系统管理提供了一种有效手段。 　　2 中医药本体工程方法学研究 　　本体工程多是面向特定领域开展的，其方法在各个领域中不尽相同。中医药领域的本体建设仍处于起步和探索阶段，其方法学体系尚未成熟、亟待完善。目前，国内外尚缺乏构建中医药领域本体的成熟流程、方法和标准规范。中医药领域的知识体系独具特色，极为复杂。中医药本体建设必然是一项复杂的系统工程，涉及中医团体的广泛参与和密切协作。若没有合适的方法学作为指导，就难以在不同的本体工程中贯彻一致的设计原则，这不利于本体的规模化和互操作。因此，需要对中医药本体工程方法学进行深入研究。 　　在方法学研究中，学者们首先提出了一些构建中医药本体的基本原则。如林氏[10]提出对中医药概念的表达不必单纯强求标准化和一致性，而应在本体的启发和应用上，完整、忠实、准确地表达中医药传统理论的语义，并做到机读、通用、可共享，为实现中医药资源数字化奠定基础。方氏[14]提出，中医药本体的建立必须在深入理解中医药领域知识的基础上进行。这些原则对本体工程的实施都具有指导意义。 　　本体工程方法学中的一项关键任务是顶层本体的设计。中医顶层本体不仅为中医本体的构建提供了框架，而且有利于实现中医本体同其他领域本体之间的整合，是构建完整中医本体的基础。高氏等[15]对中医顶层本体的构建做了初步探索，并指出中医顶层本体必须包括一般科学的概念接口、一般生物医学的概念接口和中医的最高层的抽象概念。另外，TCMLS的语义网络中包括层次化的语义类型和通用的语义关系，为TCMLS的构建提供了框架，也可被视为一个顶层本体[16]。 　　TCMLS是在本体论指导下构建的大型术语系统，旨在提供一套计算机化的术语系统，支持中医药数字资源的系统整合和深度利用，向中医团体提供开放、智能的知识服务[4，16]。方氏[14]提出了一套基于本体构建TCMLS的方案，其中涉及本体类及其层次结构、语义系统、概念集合、术语规范、通用编码等诸多方面，并提出了本体规范存储和查询的方法，以帮助用户管理和获取中医药信息。曾氏[17]论述了TCMLS的构建思路、设计原则、架构与方法，包括术语及定义的采集范围及标准、定义类（Class）和类的层次结构（Hierarc