豫西地区PRRSV新近流行株ORF5基因变异及Nsp2基因特征分析.pdfVIP

河南农业科学 ，2012，41(1)：137-141 JournalofHenanAgriculturalSciences 豫西地 区PRRSV新近流行株 ORF5基因变异及 Nsp2基因特征分析 张明亮 ，张春杰 ，程相朝 ，赵星灿 ，李银聚 ，吴庭才 ，李 正 ，杨宁宁 (1．河南科技大学 动物科技学院，河南 洛 阳 471003；2．洛阳市动物疫病预防控制中心，河南 洛阳 471002) 摘要 ：为研究豫西地 区猪繁殖与呼吸综合征病毒 (PRRSV)新近流行株 0 F5基因的变异情况及 Nsp2基 因的结构特征，采用 RT—PCR方法扩增 了26份近期采 自豫西地 区猪场疑似 PRRS猪肺 脏样品中的 ORF5全序列和Nsp2部分序列，并对其生物信 息学和结构进行 了分析。结果表明：成 功扩增 出的 21株 PRRSV 流行 株 间OR 全基 因同源性 为 96．6 ～ 100 ，氨基 酸 同源性 为 97．5 ～100 ；与参考毒株 JXA1、MIV、VR一2332和 IV 的核苷酸 同源性分别为 96．6 ～ 98．9 、88．4 ～89．2 、88．0 ～89．5 和 66．8 ～67．3 ；对 阳性病料进行 了部分 N5 基因 的扩增，测序结果显示，所有流行株的Ns 2基 因与 已报道的美洲株 VR一2332相比，不存在核苷 酸的插入或突变，但存在 2个位点共 90个碱基的缺失 ；遗传衍化分析表明，流行毒株属于美洲型。 研究结果揭示了豫西地区新近流行的PRRSVORF5基 因的变异情况及 Nsp2基 因的特征 ，为该 地 区的 PRRS防控工作提供 了理论依据 。 关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒 ；流行株 ；ORF5基 因；Nsp2基 因；变异分析 中图分类号：$858．28 文献标志码 ：A 文章编号：1004—3268(2012)01—0137—05 GeneticVariationsoftheORF5andN speGenesofthe PrevalentPRRSV Isolatesfrom W esternHenanProvince ZHANG Ming—liang，ZHANGChun—jie ，CHENGXiang—chao ，ZHAOXing—can ， LIYin—ju ，WU Ting—cai，LIZheng ，YANGNing—ning (1．CollegeofAnimalScienceandTechnology，HenanUniversityofScienceandTechnology，Luoyang471003，China； 2．IuoyangCenterofPreventionandControlofAnimalDiseases，Luoyang471002，China) Abstract：rr0 determinethegeneticvariationsoftheORF5andNsp2genesofprevalentPRRSV isolates from westernHenan，thecompleteORF 5geneandsubsequeneeforNsp2 geneofPRRSV wereampli— fledbyRrr_PCR from lungsamplesofswine．A totalof21complete0尺lF 5andsubsequenceforNs 2 sequencesweresuccessfullyamplifiedfrom 26casesamples．Homologyfor21complete0 F5geneand aminoacidssequencesare96．5 100 or97．5 一 100 ，respectively．Comparedto thereference strainsJXA1，MIV，andVR 2332，thehomologyofgenewere96．5 一98．8 ，87．4 一89．1 ，and 87．7 89．4 ．SubsequenceforN5 sequencewereamplifiedfrom positivesamplesandcompar