利用Primer Premier5．0进行引物设计.pdfVIP

维普资讯 西北医学教育 2008年8月 第16卷 第4期 NORTHWESTMEDICALEDUCA~ONAug．2008V。1．16No．4 利用 PrimerPremier5．0进行引物设计 翟中会A，陈希南 ，王 娟 (西安交通大学：A．图书馆，陕西 西安 710049；B，医学院信息中心，陕西 西安 710061) 摘要：目前，PCR引物设计大都通过计算机软件进行。本文详细的介绍了怎样利用 “PrimerPremier5．0”软件进行PCRg 物设计。 关键词 ：引物；软件 ；设计 中图分类号：G434 文献标识码：A 文章编号：1006—2769(2008)04—0695—40 PrimerDesignwithPrimerPremier5．0 ZHAIZhong—hui，CHENXi．nan ，WANG Juan (1，LibraryofXi’anJiaotongUniversity，Xi’all710049；2．MedicalCollegeofXi’anJiaotongUniversity，Xi’an710061，China) Abstract：Atpresent，PCR primersaredesignedmostlybycomputersoftware．Thispaperdescribesindetailhowtousethe“Prim- erPremier5．0”softwaretodesignPCR primers， KeyW ords：primer；software；desing 自从 1985年 KarnyMullis发 明了聚合酶链式反应 以来 ， 使用起来却不太容易。本文将就引物设计原则及软件使用问题 PCR技术已成为分子生物学研究中使用最多、最广泛的手段之 进行探讨…。 一 ，而引物设计是PCR技术中至关重要的一环。使用不合适的 1 PrimerPremier5．0主窗口介绍 PCR引物容易导致实验失败。现在 PCR引物设计大都通过计 PrimerPremier5、0是由加拿大的Premier公司开发的专 门 算机软件进行。可以直接提交模板序列到特定网页，得到设计 用于 PCR或测序引物 以及杂交探针的设计、评估 的软件 ，和 好的引物，也可以在本地计算机上运行引物设计专业软件。一 PlasmidPremier2．02一起是该公司推出的必威体育精装版的软件产品。其 般来说，专 门进行PCR引物设计的专业软件功能更为强大。但 主要界面(图1)同样也是分为序列编辑窗口(Genebank)，引物 图 1 程序 的引物设计窗 口 设计窗口(PrimerDesign)，酶切分析窗口(RestrictionSites)和纹 收稿 日期：2008—03—19 基分析窗口(Motif)。这里我们主要介绍其引物设计功能。 作者简介 ：翟中会(1974一)，男，医学信息学专业 ，在读计算机应用 该界面共分为四层 ，最上面一层左面是 5个控制按钮，用于 专业硕士。 695 ·