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RAGE、NF-κB反义RNA单-双基因共表达载体构建及序列测定
RAGE、NF-κB反义RNA单/双基因共表达载体构建及序列测定
作者:游捷 ,黄清玲 ,林旭 ,刘礼斌 ,林建银
【摘要】 目的 构建晚期糖化终产物受体(RAGE)、核因子-κB(NF-κB)反义RNA单/双基因共表达载体。 方法 从人脐静脉内皮细胞ECV304中提取总RNA,RT-PCR扩增RAGE基因片段;从糖尿病人外周血单核细胞提取总RNA,RT-PCR扩增NF-κB p65基因片段。分别克隆入PGEM-T载体,酶切鉴定阳性克隆,再经PCR反应获得多量的RAGE,NF-κB基因片段,反向插入双启动子真核表达载体pBudCE4.1,构建RAGE、NF-κB反义RNA单/双基因共表达载体。 结果 RT-PCR扩增出RAGE基因片段328bp,扩增出NF-κB p65基因片段364bp。测序分析证实目的基因片段正确反向插入3个重组载体。 结论 RAGE、NF-κB反义RNA单/双基因共表达载体构建成功。
【关键词】 RNA,反义;基因表达调控;糖基化终产物,高级;糖基化;NF-κB;基因;DNA,重组;遗传载体
晚期糖化终产物(AGE)在糖尿病、肾功能衰竭、衰老、炎症等情况下明显增加。AGE主要通过晚期糖化终产物受体(RAGE)介导病理情况。目前认为,AGE-RAGE作用后可引起核因子(NF)-κB的激活。NF-κB是调节RAGE表达的一个启动子,因此NF-κB的激活作为一种正反馈,进一步促进了AGE与RAGE的结合 [1-2] 。笔者构建RAGE、NF-κB反义RNA单/双基因共表达载体,为今后进一步研究阻断AGE-RAGE的策略打下基础。
1 材料与方法
1.1 材料 E.coli Top 10 、PGEM-T载体、双启动子型真核表达载体pBudCE4.1、高保真PCR酶、dNTP、一步法RT-PCR试剂盒、Trizol、Zeocin、IPTG、X-Gal、DEPC(Invitrogen公司)。限制性内切酶、T 4 DNA连接酶(Biolab公司)。胶回收试剂盒、小量质粒抽提试剂盒(上海华舜生物制品公司)。人脐静脉内皮细胞ECV304(中科院上海细胞生物研究所)。上海博亚生物技术有限公司合成引物及测序。
1.2 方法
1.2.1 根据GeneBank报道的人RAGE基因(GeneBank登录号AB036432)、人NF-κB p65基因(GeneBank登录号M62399)设计引物,扩增RAGE基因序列的14-342位的328bp序列。扩增NF-κB p65基因序列的14-378位的364bp序列。PCR引物如下:
RAGE F:5’-GGG GTA CCA AGG AAG CAG GTA GGC AGC C-3’
RAGE R:5’-CCG CTC GAA TCC ATT CCT GTT CAT CTG C-3’
NF-κB p65F:5’-CGC GGA TCC TGG CTC GTC TGT AGT GCA CG-3’
NF-κB p65R5’-CCC AAG CTT TAG AAG CCA TCC CGG CAG TC-3’
1.2.2 RAGE、NF-κB基因的体外扩增及扩增片段的回收 Trizol试剂提取ECV304总RNA,RT-PCR扩增RAGE基因片段,反应体系:总体积50μL由引物RAGE R,RAGE F各3μL、RNA3μL、dNTP1μL、5×buffer缓冲液10μL、RT/Taq酶1μL、DEPC水26.5μL构成。反应条件:55℃逆转录反应60min→94℃变性2min→94℃30s→55℃30s→72℃1min,共30循环,72℃延伸7min。扩增产物于1.0%琼脂糖凝胶中电泳。另取一名血糖控制较差、无急性并发症的糖尿病人外周血有核细胞提取总RNA用于扩增NF-κB基因片段,RT-PCR反应体系、反应条件同上。胶回收试剂盒回收2种目的基因片段。
1.2.3 RAGE、NF-κB基因PGEM-T载体克隆 将目的基因RAGE、NF-κB片段与PGEM-T连接,并转化感受态细胞E.coli Top 10 ,将菌液涂抹至预先制备含IPTG/X-Gal/氨苄青霉素的LB平板上,蓝白筛选,扩增阳性克隆并小量抽提质粒,xhoⅠ、kpnⅠ(RAGE)/HindⅢ、BamH I(NF-κB)双酶切鉴定。阳性质粒命名为PGEM-T/RAGE,PGEM-T/NF-κB。
1.2.4 pBudCE4.1/RAGE重组载体的构建 取PGEM-T/RAGE质粒DNA,用引物RAGE R、RAGE F扩增RAGE目的基因。PCR反应体系:总体积50μL,由引物各3μL,质粒DNA2μL,dNTP1μL,10×buffer缓冲
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