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同源建模技术
同源建模(HomologyModeling)是一种基于已知蛋白质结构预测未知蛋白质结构的计算方法。当一个蛋白质的三维结构未知,但其氨基酸序列与一个或多个已知结构的蛋白质有较高的相似性时,可以通过同源建模技术来预测其三维结构。这种技术在动物基因组学中尤为重要,因为许多动物蛋白质的结构尚未被实验确定,而通过同源建模可以快速获得这些蛋白质的结构模型,从而进一步研究其功能和作用机制。
1.同源建模的基本原理
同源建模的基本原理是利用已知的蛋白质结构(模板,Template)来推断未知蛋白质的结构(目标,Target)。具体步骤包括:
序列比对:
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