兔CCR9基因的克隆与序列分析.pdfVIP

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江西农业学报 2008,20(10):1~3 AetaAgriculturaeJiangxi 兔 CCR9基因的克隆与序列分析 贾海丽,惠参军,乔新安,韩立强,王月影,王艳玲,杨国宇 (河南农业大学动物生理生化实验室,河南郑州450002) 摘 要:设计 l对克隆引物,从兔十二指肠黏膜组织提取总RNA,进行RT—PCR,将PCR产物与pMD19一T载体连接后转 化EcoliJM109感受态细胞,检测阳性克隆、测序并进行序列分析。结果表明:克隆的兔CCR9基因长为624bp,编码由208个 氨基酸残基组成的CCR9前体蛋 白,预测CCR9具有多个跨膜区。克隆的兔CCR9基因与绵羊、人的同源性分别为82.9%、 82.7%;推导的兔CCR9氨基酸序列与绵羊、人的同源性分别为80.1%、82.2%,其结构特征与绵羊、人的相一致。 关键词:兔;CCR9基因;克隆;序列分析 中图分类号:S829.1 文献标识码:A 文章编号:1001—8581(2008)10—0001—03 MolecularCloningandSequenceAnalysisofGeneCCR9inOryctolaguscuniculus JIAHai—li,HUICan—jan,QIAOXin—na,HANLi—qinag,WANGYue—ying,WANGYan—ling,YANGGuo—yu ‘ (CollegeofAnimalHusbandryandVeterinaryMedicine,Henna AgriculturalUniversity,Zhengzhou450002,China) Abstract:A pairofcloningpriinersweredesired,totalRNA wage~metedfrom theduodenum muco6altissueofOryaot.~ an.//c- u/ns.andmRNA sequenceWag amplifiedbyRT—PCR.rI11ePCRproduaswereligatedintothepMD19一Tvector,andhtentransformed intocompetentceilsofE colJM109.田lepositivecloneWag identifiednadtheseq1.1enoc wag testednadnaalyzed.Theresultsindicate tl1atgeneCCR9inOryctolagns cuniculushashtelengthof624bpnadencodes208aminoacids.TertiarysturcturepredictsthatCCR9con- taiIISseveraldomai.s.IdentityanalysisshowsthattheCCR9nucleotideseql/enoc in 伽 cun/cu/usshares82.9% ,82.7% homolo- gYwiht thatofOv/sareisnadHomosapeinsrespcetively,nadthepredictedaminoacidseqalenoc of CCR9inD cun/cu/usshares 80.1% ,82.2% homologywiththatofOvisaries,Homo sapiensrespectively,revealingthatthestructuralfeatureofhtefomr erCCR9is consistentwiththelattertwoCCR9s. Keywords:Oryctolagns cuniculus;GeneCCR9;Molceularcloning;Sequencenaalysis 趋化因子是一系列结构相似、有20%~70%氨基酸 等(2007)克隆了羊 CCL25及其受体CCR9,并研究了它 同源性且能控制免疫细胞做定向迁移的小分子细胞因子 们在黏膜免疫组织中的表达 。目前,这种趋化因子受 超家族,与感染、白细胞运输和免疫细胞分化的调节有 体已经从不同物种独立克隆出来,尚未见兔 CCR9基因 关,在多种炎I生疾病中起重要作用 .。它们通过结合特异 的相关研究。笔者利用人ESTs拼接

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