应用PCRDGGE技术分析泡菜中乳酸菌多样性.pdfVIP

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应用PCR—DGGE技术分析泡菜中乳酸菌的多样性 付琳琳 曹郁生 李海星 陈 燕 (南昌大学中德联合研究院食品科学教育部重点实验室,南昌,330047) 摘要从泡菜液中抽提总DNA.扩增16SrDNA的v7一V8区,变性梯度凝肢电泳分离PCR片段,发现不同样 品间的菌种差异显著。对片段直接测序和克隆测序,进行Blast分析,绘制进化树。结果表明.DGGE和克隆技 术相结合是研究泡菜中乳酸菌多样性的可行方法。 关键词 泡菜,多样性,PCRDGGE,乳酸菌 50 自从Muyzer_11首次将PCR—DGGE技术用于研液洗涤菌体3次,加入145L裂解缓冲液,40 pL 究微生物多样性以来,近年来DGGE己被广泛应用mg/mL的溶菌酶,15u的变溶菌素,37℃保温3h, 于各种环境微生态的研究,如高温热泉、湖泊、江河、 加入400 CTAB缓冲液,20 pL pL20mg/mL的蛋白 海洋、根际、土壤、沙丘等。在国外,PCR—DGGE广 酶K,50℃保温2 泛用于研究食品微生态,鉴定微生物,评价食品质量, 如益生菌制品、2l、酸面团旧』、干酪_41等。国内尚未见 到将PCRDGGE用于食品微生态研究的报道。本 h。 10mg/mL的RnaseA,37℃保温3 文首次利用DGGE技术对家庭泡菜中乳酸菌的多样1.3 PCR扩增 性进行了初步研究。 mmol/L 液5 dNTP3 PCR引物 1材料与方法 ftL,2.5 pL,5kLmolZL 各2弘L,Taq酶2.5pL,模板DNA3pL。采用降落 1.1材料 PCR进行扩增:94℃预变性2rain;94℃30S,60℃60 1.1.1样品的采集与处理 s,72℃60S,退火温度每两个循环降低1.5℃,当退 样品采自不同家庭制作的成熟期的泡菜液,用4 火温度降至54℃后,再以该温度扩增25个循环;最 层无菌纱布过滤取清液。 后72℃补平15 1.1.2参考菌株 胶进行电泳,割胶回收月的条带。 乳酸乳球菌乳脂亚种1.9(Lactococcus.1actis 1.4变性梯度凝胶电泳(DGGE) subsp.cremorls1.9), 嗜热链球菌1.1855 1.1855),干酪乳杆菌 (Streptococcusthermophilus 行电泳,恒压20V,10min,然后130V,4h,银染。试 casei 1.574(Lactobacillus1.574),购自中国微生物剂盒倒收片段。 菌种保藏中心。 1.5直接测序和序列分析 5o 1.1.3PCR引物L 以回收产物为模板,进行PCR扩增,送上海生工 P1:5’一GT

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