栽培稻种内核糖体基因的ITS序列比较研究.pdfVIP

维普资讯 作物学报 ACTAAGRONOMICASINICA 2007，33(11)：1874—1878 http：／／www．chinacrops．org／zwxb／ ISSN0496—3490：CODEN TSHPA9 E-mail：xbzw@chinajourna1．net．cn 栽培稻种 内核糖体基 因的 ITS序列 比较研究 戴小军 梁满 中 陈良碧 (湖南师范大学生命科学学院，湖南长沙410081) 摘 要 ：以普通野生稻 (0．rufipogon)为外类群 ，对栽培稻 (0．sativa)籼亚种 (0．sativassp．indicn)和粳亚种 (O．n砌n ssp．仲 oncn)18个材料的核糖体基因(rDNA)内转录间隔区(internaltranscribedspacers，ITS)全序列进行 比较分析 。供试材 料 中有籼亚种品种 (系)9个 ，粳亚种 品种 (系)6个 ，爪 哇稻 2个和陆稻 1个。结果发现 ，栽培稻种 内总变异位点 23个 ，占 总碱基数 的5．4l％；8个信息位点，占总碱基数 的 1．82％。籼亚种 ITS全序列 的长度为 425～430bp，G+C含量为 74．25％～75．59％；粳亚种 ITS序列总长度为 425bp，G+C含量为 74．25％～75．59％。以Irl、S全序列构建的系统树能将栽 培稻区分为籼、粳 2个亚种群 ，爪哇稻与籼稻有较近的亲缘关系，这对研究栽培稻的演化有 定的指导意义。 关键词 ：栽培稻 ；核糖体 ；内转录间隔区；系统树 ComparisonofrDNA InternalTranscribedSpacerSequencesin Oryzasativa L． DAIXiao—Jun，LIANG Man—Zhong，andCHEN Liang—Bi (CollegeofLifeScience，HunanNormalUniversity，Changsha410081，Hunan，China) Abstract：Thecultivatedricehasbeendifferentiatedandbecamenotonlytwodistinctlydiscriminativesubspecies，i．e． 0．sativassp．indicaandO．sativassp．japonicabutalsomanyecotypesofthesetwosubspeciesrespectively．Whatis thevariationlawoftheITS1andITS2sequences；nvarietiesofacertainspecieswithhighbiologicaldiversity?CantheITS region be a usefultoolto study the phylogenetic relationships among these cuhivars? Both ofthese are worthy of investigation．Inthisstudy，acomparativeanalysisoftherDNA internaltranscribedspacers (ITS)entiresequencesof18 cuhivarsinOryzasativaL．wascarriedoutwithO．rufipogonasoutgroup．Inthe18cuhivars，therewere90．sativa ssp．indicavarieties，6typicalO．sativassp．japonica，2 0．sativassp． 0nc0 and1uplandrice．Theresult indicatedthattherewere23variationallociwhichwere5．41％ ofentirebasesand8informativelociwhichwere1．82％ of entirebasesin Oryzasativa．ThelengthrangeofITS sequencein O．sativa ssp．indica wasfrom 425 to430