基于加权共表达网络分析对下咽癌枢纽基因HOXB9的鉴定.pdfVIP

第３９卷第９期川北医学院学报(ｈｔｔｐ://ｎｏｔｈｃｂｐｔｃｎｋｉｎｅｔ)Ｖｏｌ３９ꎬＮｏ９

２０２４年９月ＪＯＵＲＮＡＬＯＦＮＯＲＴＨＳＩＣＨＵＡＮＭＥＤＩＣＡＬＣＯＬＬＥＧＥＳｅｐ.２０２４１１５３

ｄｏｉ:１０３９６９/ｊｉｓｓｎ１００５￣３６９７２０２４０９００１基础研究

基于加权共表达网络分析对下咽癌枢纽基因ＨＯＸＢ９

的鉴定

１２１１１

唐进渝ꎬ刘康ꎬ钟春燕ꎬ黄琴ꎬ杜经纬

(川北医学院附属南充市中心医院ꎬ１.耳鼻咽喉头颈外科ꎻ２.组织工程与干细胞研究所ꎬ四川南充６３７０００)

【摘要】目的:探讨基于加权共表达网络分析ꎬ用免疫组织化学法对其结果进行验证ꎬ分析枢纽基因ＨＯＸＢ９在下咽癌中

的作用ꎮ方法:根据ＴＣＧＡ的数据ꎬ确定了３４９６个头颈鳞状细胞癌(ＨＮＳＣＣ)和正常样本之间差异表达的基因ꎻ选择这些差

异基因进行富集分析及加权基因共表达网络分析(ＷＧＣＮＡ)确定ＨＮＳＣＣ患者临床特征相关的基因模块ꎻ随后对其中的枢纽

模块进行预后生存分析发现关键基因ꎻ对关键基因进行免疫组织验证ꎮ结果:数据分析得出肿瘤中的差异表达基因及关键

基因模块ꎻ关键模块基因的预后生存分析发现１１个关键基因ꎻ通过免疫组化验证ＨＯＸＢ９ꎬ证实ＨＯＸＢ９在下咽癌中表达水平

明显上调(Ｐ０.０５)ꎮ结论:ＨＯＸＢ９在下咽癌肿瘤中明显高表达ꎬ且可能与肿瘤分期及淋巴结转移相关ꎬ这可能成为下咽癌

潜在的预后标志物及治疗靶点ꎮ

【关键词】同源盒Ｂ９ꎻ头颈部鳞状细胞癌ꎻ下咽癌ꎻ数据库分析

【中图分类号】Ｒ７６６.５【文献标志码】Ａ

ＩｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎｏｆｔｈｅｈｙｐｏｐｈａｒｙｎｇｅａｌｃａｎｃｅｒｈｕｂｇｅｎｅＨＯＸＢ９ｂａｓｅｄｏｎ

ｗｅｉｇｈｔｅｄｃｏ￣ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｎｅｔｗｏｒｋａｎａｌｙｓｉｓ

１２１１１

ＴＡＮＧＪｉｎ￣ｙｕꎬＬＩＵＫａｎｇꎬＺＨＯＮＧＣｈｕｎ￣ｙａｎꎬＨＵＡＮＧＱｉｎꎬＤＵＪｉｎｇ￣ｗｅｉ

(１.ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＯｔｏｌａｒｙｎｇｏｌｏｇｙꎻ２.ＲｅｓｅａｒｃｈＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＴｉｓｓｕｅＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇａｎｄＳｔｅｍＣｅｌｌꎬＨｅａｄａｎｄＮｅｃｋＳｕｒｇｅｒｙꎬＮａｎｃｈｏｎｇＣｅｎｔｒａｌ

ＨｏｓｐｉｔａｌꎬＮｏｒｔｈＳｉｃｈｕａｎＭｅｄｉｃａｌＣｏｌｌｅｇｅꎬＮａｎｃｈｏｎｇ６３７０００ꎬＳｉｃｈｕａｎꎬＣｈｉｎａ)

【Ａｂｓｔｒａｃｔ】Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ:ＴｏｅｘｐｌｏｒｅｔｈｅｒｏｌｅｏｆｔｈｅｐｉｖｏｔａｌｇｅｎｅＨＯＸＢ９ｉｎｈｙｐｏｐｈａｒｙｎｇｅａｌｃａｒｃｉｎｏｍａｂａｓｅｄｏｎｗｅｉｇｈｔｅｄｃｏ￣ｅｘｐｒｅｓ￣

ｓｉｏｎｎｅｔｗｏｒｋａｎａｌｙｓｉｓａｎｄｖａｌｉｄａｔｉｏｎｏｆｔｈｅｒｅｓｕｌｔｓｂｙｉｍｍｕｎｏｈｉｓｔｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ.Ｍｅｔｈｏｄｓ:３ꎬ４９６ｇｅｎｅｓｔｈａｔｗｅｒｅｅｘｐｒｅｓｓｅｄｄｉｆｆｅｒｅｎｔｌｙｂｅ￣

ｔｗｅｅｎｈｅａｄａｎｄｎｅｃｋｓｑｕａｍｏｕｓｃｅｌｌｃａｒｃｉｎｏｍａ(ＨＮＳＣＣ)ａｎｄｎｏｒｍａｌｓａｍｐｌｅｓｗｅｒｅｆｏｕｎｄｕｓｉｎｇｄａｔａｆｒｏｍＴｈｅＣａｎｃｅｒＧｅｎｏｍｅＡｔｌａｓ

(ＴＣＧＡ).Ｔｈｅｓｅｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙｅｘｐｒｅｓｓｅｄｇｅｎｅｓｗｅｒｅｃｈｏｓｅｎｆｏｒｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔａｎａｌｙｓｉｓａｎｄｗｅｉｇｈｔｅｄｇｅｎｅｃｏ￣ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｎｅｔｗｏｒｋａｎａｌｙｓｉｓ

(ＷＧＣＮＡ)ꎬｗｈｉｃｈａｉｍｅｄｔｏｉｄｅｎｔｉｆｙｇｅｎｅｍｏｄｕｌｅｓａｓｓｏｃｉａｔｅｄｗｉｔｈｃｌｉｎｉｃａｌｆｅａｔｕｒｅｓｏｆＨＮＳＣＣｐａｔｉｅｎｔｓ.Ａｄｄｉｔｉｏｎａｌｌｙꎬｐｒｏｇｎｏｓｔｉｃｓｕｒｖｉｖａｌ

ａｎａｌｙｓｉｓｏ