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广西猪戊型肝炎分子流行病学调查及基因型分析
人兽共患病一病毒病
广西猪戊型肝炎分子流行病学调查及基因型分析
秦毅斌1·2 赵武2’肖爱欢1·2李斌2梁家幸2刘芳1何颖2
梁保忠2姚瑞英2黄安国2蒋玉雯2黄伟坚1’
(1广西大学动物科学技术学院,广西南宁530005;2广西兽医研究所,广西南宁530001)
摘要 戊型肝炎病毒(阳!v)是导致人急性肝炎的主要病原之一,它还可以感染多种动物,且大多都不出现,临床
症状。猪是HEv传播过程中的重要的储存器。本研究选取广西不同地方的25个猪场的294份3月龄左右的猪粪便
以及采集市场销售的90份猪肝脏,用RT.nPCR方法检测了HEVRNA,调查广西猪戊型肝炎的流行情况。结果,在
13l份粪便可检测到HEvRNA,阳性率为44.6%;被检的25个猪场中存在HEv的有18个场,猪场阳性率为72.O%;
遗传进化分析表明,获得所有毒株都属于基因Ⅳ型。
关麓词猪;戊型肝炎;流行病学;基因型
戊型肝炎是由戊型肝炎病毒(HEV)引起的主要通过消化道感染的急性病毒性肝炎,主要通过粪
口途径传播。戊型肝炎主要侵害青壮年,戊肝患者的病死率为1%一2%,较其他各型肝炎高,孕妇的
戊型肝炎死亡率高达20%以上。戊型肝炎是一种潜在的人畜共患传染病,多种动物体内可检测到HEv
抗体或RNA:日本现已报道多起食用HEV污染的未煮熟的肉制品发生感染的病例。目前,戊肝被
世界卫生组织认为是发展中国家的一个重要公共卫生问题。
HEV为无囊膜的单股正链RNA病毒,是戊型肝炎病毒科戊型肝炎病毒属的唯一成员:基因组
长约7.2Kb,含有3个部分霞叠的开放阅读框(openreadingframe,ORFs)。自病毒基凶组的5’末端到
或更多的腺嘌吟核苷酸组成的多聚腺苷酸尾(polyA)。oRFl编码一个非结构聚蛋向,生成与病毒复
制相关的甲基转移酶、木瓜蛋白酶样半胱氨酸蛋白酶、RNA解旋酶及RNA依赖的RNA聚合酶等;
ORF2编码的结构蛋白具有典型的病毒衣壳蛋白特征;oRF3编码的磷酸化非结构蛋白,其功能尚不
清楚。
根据序列分析,眦V分为4个主要的基因型:(1)基因I型,即哑洲.非洲型,流行于亚非多数国
家,以缅甸株原型为代表;(2)基因Ⅱ型,即墨西哥型,代表株为墨西哥株、尼日利亚株和新近在纳
米比亚发现的二株;(3)基冈III型,即美国型,包括美国株USl、US2和美国猪眦v分离株,分布
最为广泛,美洲、欧洲、亚洲及大洋洲多个国家均有报道;(4)基因Ⅳ型,即中国基因型,包括中国、
印度、越南、中国台湾和日本等亚洲国家分离的HEV毒株。基因I型和Ⅱ型髓v以感染人为主,
基因III型和Ⅳ型可感染人和多种动物。我国人群感染的HEV有I基因型和Ⅳ型,且以Ⅳ型占优势;
我国猪群中广泛流行基因Ⅳ犁的HEV,III型的报道仅有一例。
为了解广西地区猪源戊型肝炎的流行情况,本研究采用RT-nPcR方法对广西各地二十多个猪场
进行了调查,了解了广西猪群HEV的感染情况及流行基因型。
1材料与方法
1.1材料
1.1.1标本
于2008年11月~2009年4月间采集南宁、柳州、桂林、贺州、贵港、玉林、崇左、钦州、百
色等广西不同市县的规模化养猪场3月龄左右的新鲜猪粪便,采集市场上销售的新鲜猪肝脏和广西
各地送本实验室剖检猪的肝脏。
1.1.2引物
参考已发表在NCBI上的四种基因型的艇V毒株基因组全序列,在oI强一2基因内的保守区设
基金项目:广西基本科研业务费专项课题(桂兽研专项08-3)
作者简介:秦毅斌(1983一),男,广西桂林人,硕士研究生;E.majl:qinyibin5188@163.com
zllaowul68866@163.com
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第十三次学术研讨会会议论文集
AAYCAAGGH TTR
TGGCG一3’,HEv-B5’一TGYTGGTCRTARTCCTG一3’,HEV二C5’.ACYTCH
GGBGTBGCKGAGGA一3’,HEV.D5’一GCTCGCCATTGGCTGAGAC.3’。
1.13蓑体与菌株
DH5Q菌株,由本实验室保存。
pMDl8.TV&tor,为毗出a公司产品。E.con
1.1.4分子生物学试荆
1尉zol和dNrP(各10rnJⅥo儿)
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