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富集培养的低温纤维素降解细菌菌群结构分析
孟建宇 樊兆阳 李蘅 陶羽 王瑞刚 冯福应
内蒙古农业大学生命科学学院应用与环境微生物研究所,呼和浩特 010018
通讯作者,fengfuying@imau.edu.cn
摘 要 内蒙古大兴安岭森林土壤 中低温纤维素降解菌资源丰富,本研究 旨在分析其菌群结构 。在
1O℃下,用羧 甲基纤维素~(CMC—Na)培养基对样品中的低温纤维素降解菌进行富集传代培养,用3,5一二
硝基水杨酸(DNS)法测定纤维素酶活性,以细菌16SrDNA通用引物(341F和907R)进行V3NV5区域PCR
扩增,以变性梯度凝胶 电泳(DGGE)对PCR产物进行电泳,获得 16SrDNA指纹图谱后分析细菌菌群结
构。研究结果表明,低温富集传代过程中,相对酶活随着培养代数的增加而不断增加,第4代的相对酶活
最高,为30.625IU;每代都有菌种的消失和增加;富集培养液 中包含属于cc.变形菌纲(—Proteobacteria)、B一
变形菌纲(B—Proteobacteria)、Y.变形菌纲(Y—Proteobacteria)、硬壁菌fq(Firmicutes)和拟杆菌fq(Bacteroidetes1
类群的细菌,其中硬壁菌门类群(65.5%)和p一变形菌纲类群(13.8%)的细菌为优势菌。本研究证实,内蒙古
大兴安岭森林土壤有丰富的低温纤维素降解菌资源,有潜在的应用前景。
关键词 低温纤维素降解菌,富集培养,群落结构,变性梯度凝胶 电泳(DGGE)
AnalysisofCold--adapted Cellulose--degrading BacterialCommunity
StructuresUnderEnrichmentCulutringConditions
MENGJian—Yu FANZhao—Yang LIHeng TAOYu WANGRui—Gang FENGFu—Ying
Institution forApplied andEnvironmentalMicrobiologyofLife SciencesCollege,InnerMongoliaAgriculutralUniversity,Hohhot010018,
China
Correspondingauthor,fengfuying@imau.edu.cn
Abstract Thereareabundantcold-·adaptedcellulose--degradingbacteriaresourcesfrom soilin theDa
HingganforestofInnerMongolia.Thisstudywasaimedatanalyzingthecommunity strucutreofcold-
adaptedcellulosedegradingbacteria.Cold—adaptedcellulose—degradingbacteriawereisolatedbyenrichment
culutreusingsodium saltofcaboxymethylcellulose(CMC—Na)medium at10oC.Cellulaseactiviytwas
determinedby3,5一dinitrosalicylicacid(DNS)method.The16SrDNAgenes(V3-V5region)wereamplified
byusingtheuniversalprimers(341Fand907R).ThePCRproductswereelectrophoresedbydenaturing
gradientgelelectrophoresis(DGGE)
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