中国17个汉族人群3个STR基因座遗传关系探究.docVIP

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中国17个汉族人群3个STR基因座遗传关系探究

中国17个汉族人群3个STR基因座遗传关系探究   作者:龙友国,邱祥智,龙思方,余跃生,戎聚全 【摘要】 目的 探讨中国17个汉族人群3个STR基因座的遗传关系。方法 收集中国17个汉族人群D16S539、D7S820和D13S317基因座的基因频率资料,计算他们间的遗传距离,构建系统发生树。结果 江苏、河南、太原、江西、安徽、台湾和深圳汉族聚为一大类,泉州、广东、福建、潮汕汉族为一类,荆州、成都、湖南、西安和贵州汉族为一类,而广西汉族单独为一类。结论 研究结果与遗传学和民族学研究结果一致,并提示17个汉族人群STR基因频率分布与地理距离呈平行关系。 【关键词】 STR;遗传距离;系统发生树;群体遗传学;汉族;中国   Abstract: Objective To study the genetic relationship (3 short tandem repeat gene loci,abbreviated as 3 STR gene loci) in 17 groups of Han population in China. Methods Genetic data of D16S539,D7S820,and D13S317 STR gene loci on 17 groups of Han population were collected,genetic distance was calculated and the Pylogenetic Tree chart was constructed based on the genetic distances among seventeen groups of Han population.A Neighbor-Joining method was used to draw the Pylogenetic Tree. Results The Pylogenetic Tree showed that the seven groups of Han population in Jiangsu,Henan,Taiyuan,Jiangxi,Anhui,Taiwan and Shenzhen cities or provinces were involved in an identical cluster;Quanzhou,Guangdong,Fujian,and Chaoshan in another,and Jingzhou,Chengdu,Hunan,Xian and Guizhou in another,and Guangxi Han population in an unattached cluster. Conclusion The study results were in accordance with the researched outcomes of genetic and ethnology.This indicated that the STR gene frequency distribution in seventeen groups of Han population is parallel with the geographic distance.   Key words: STR;genetic distance;phylogenetic tree;population genetics;Han population;China   微卫星DNA (microsatellite DNA),又称短串联重复序列(short tandem repeat,STR),约占人类基因组的10%,重复单位长1~6bp,重复次数10~60次,等位基因片断长度一般在100~500bp。它因数目多、分布广,并具有高度多态性、高信息含量以及高杂合度而被广泛应用于人群遗传学、法医个体识别、人类学、民族学和考古学等领域[1]。黄辰等[2]利用D16S539、D7S820和D13S317基因座的基因频率资料对我国7个民族间的遗传关系进行了研究,但尚未见有利用这几个基因座对汉族人群遗传关系研究的报道。笔者收集成都、湖南、贵州、河南、西安等地区17个汉族人群D16S539、D7S820和D13S317基因座基因频率的文献资料,以探讨他们间的遗传关系,对了解汉族的起源、进化和迁移具有较高的参考价值。   1 对象与方法   1.1 研究对象 收集中国安徽、成都、湖南、福建、江苏、贵州、江西、台湾、潮汕、广西、泉州、太原、河南、西安、荆州、广东和深圳等地区17个汉族人群D16S539、D7S820和D13S317基因座的基因频率资料,各基因座的基因型频率分布均符合Hardy

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