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生物芯片研究进展..ppt
生物芯片研究进展 利用基因芯片研究干旱胁迫下玉米基因表达 玉米是全球第一大作物、我国第二大作物,而干旱是影响其产量的重要限制因素。山东大学生命科学院张举仁教授的课题组利用基因芯片技术研究了开花期玉米顶叶干旱胁迫下基因的表达。 开花期是玉米需水临界期,对干旱胁迫反应最敏感,此时逢干旱会使产量下降幅度最大。张教授的课题组以开花期玉米为材料,分别对其进行短期和长期的干旱胁迫,采用全基因组芯片研究了顶叶中基因的表达情况。 分析的结果表明,有197个基因在短期胁迫下差异表达(53%上调),而在长期胁迫下,则有1009个基因差异表达(32%上调)。分离得到的差异表达基因中约有一半的基因功能未知,其他基因按功能则可分为:代谢相关;细胞信号转导;转录相关;蛋白质合成;细胞防御;细胞运输;亚细胞定位等几大类。 分析实验表明,在短期胁迫下上调表达的基因中,约有1/3的已知功能基因属于信号转导功能的分类范畴,参与细胞内不同的信号转导途径,这表明信号转导相关基因在玉米对干旱的早期反应中起重要作用。而在长期干旱条件下,顶叶中大量的代谢相关基因差异表达。 张教授课题组的这项研究分离得到众多开花期玉米干旱胁迫诱导差异表达的基因,为下一步鉴定其功能、明确其在植物抗旱方面的作用,和开展玉米抗旱基因工程研究提供依据。 大连化物所微流控芯片研究工作 中科院大连化物所秦建华研究员、林炳承研究员领导的微流控芯片研究组在国际刊物Lab??on??a??Chip连续发表3篇论文,显示了该研究组在微流控芯片研究领域取得的重要进展。论文“Cell-based??High??Content??Screening??using??Microfluidic??Device”被选为封面文章。这项工作以药物诱导肿瘤细胞凋亡为模型,构建了一种基于细胞水平的高通量和高内涵药物筛选平台,将细胞培养、药物浓度梯度生成、细胞受激和细胞响应等过程完全集成在一块只有几平方厘米大小的芯片上完成,充分体现了微流控芯片将多种单元技术灵活组合和规模集成的特点,具有重大应用前景。Lab??on??a??Chip是微流控芯片领域的国际重要刊物,影响因子为5.82。 生物芯片在药物分析中的应用 生物芯片在药物分析中的应用主要是指采用毛细管电泳芯片/质谱系统对化合物库、血样和尿样中的药物进行分析鉴定,具有快速、准确、微量等优点 。 毛细管电泳芯片/质谱系统是指将毛细管电泳芯片和质谱联用的一套装置。毛细管电泳芯片进行样品的分离,而与芯片联用的质谱则有选择性的对分离成分进行检测。 生物芯片在中药鉴定中的应用主要是对植物细胞进行基因测序。因为任何一个生物个体,不受发育阶段影响,其不同组织器官部位以至细胞都具备相同的遗传信息,不同生物的遗传信息是不相同的。因此,利用生物芯片可以准确无误的确定中药的来源。已有学者开始对地道与非地道药材如贝母、金银花等的DNA序列进行研究,分离特异核苷酸序列作为探针并制备DNA芯片,进行鉴定。在同一时间内能分析大量基因,所以可用于寻找新的有效化学成分、提高药物鉴定能力和效率,还可用于中药复方组成的鉴定。采用基因芯片技术鉴定中药的过程是:①应用分子生物学技术找出待鉴定中药的特点寡核苷酸序列。(以此寡核苷酸序列作为探针装配到芯片上。(检测样品的准备(DNA提取、扩增和荧光标记) ②检测样品与芯片上探针进行杂交:荧光检测及结果分析。 用生物芯片技术还能对中药的有效成分进行鉴定 分子生物学认为中药有效成分含量受产地、气候、环境的影响是通过基因表达起作用的,基因表达的变化与中药特定阶段成份特征根本相关。因此收集标准中药材、提取DNA、建立CDNA文库,克隆各基因片段、组成DNA微阵列基因芯片,用芯片与标准药材RNA杂交,其结果可结合计算机技术建立生药标准品数据库。用于快速筛选高品质药材,井建立生药质量标准。同理,此类基因芯片可以遴选出有效成份组成相近的某稀有或濒危物种的替代者,开发新药资源。这是开发中草药使之更为科学化,打开国际市场的优选方法。 Genome?Biology:全基因组芯片分析家蚕基因表达特征 国际生物学权威期刊Genome??Biology在线发表了西南大学蚕学与系统生物学研究所夏庆友教授领衔的课题组关于利用家蚕全基因组芯片分析家蚕多种组织基因表达特征的必威体育精装版研究成果。 家蚕是重要的经济昆虫,既能用于蚕丝的生产、也能作为生物反应器生产外源蛋白;同时,家蚕也是鳞翅目昆虫生化、分子遗传以及基因组研究的模式生物。2003年,夏教授所在的团队与中国科学院北京基因组研究所合作完成了家蚕全基因组的测序工作,构建了世界上第一张家蚕基因组框架图,2004年12月出版的Science期刊上发表了相关成果。家蚕全基因组序列的完成,为家蚕功能基因组研究及其重要经济性状的分子改良奠
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