几个中国大麦属物种叶绿体psbL和psbJ基因序列分析.pdfVIP

维普资讯 植物遗传资源学报2005，6(1)：15～19 JournalofPlantGeneticResources 几个中国大麦属物种叶绿体psbL和psbJ 基因序列分析 魏育明，颜泽洪，吴 卫，郭 红，张志清，郑有 良 (四川I农业大学小麦研究所，都江堰 611830) 摘要：对8份来源．于中国和2份来 自国外的不同大麦属物种或亚种叶绿体基因组 psbL～psbJ区进行了序列测定。结果 表明，10份大麦属材料的psbL～psbJ区序列长度均为365bp，且无变异位点。同时，将大麦属 psbL～psbJ区序列与已报道的 黑麦(SecalecerealeL．)、小麦(TriticumaestivumL、)、水稻(0ryzasativaL．)和玉米 (ZeamaysL．)的相同序列比较 ，发现所有 物种的psbL基因序列长度均为 117bp，且无核酸变异位点；psbJ基 因序列长度均为 123bp，共检测到6个核酸变异位点。除水 稻外，所有物种 psbL和psbJ基因间区长度均为125bp，水稻 psbL和psbJ基因间区为 126bp。在 psbL和psbJ基因间区，除水 稻具有 1个插入位点外，还发现 8个核酸变异位点。psbL～psbJ区揭示的大麦属物种 、黑麦、小麦、水稻和玉米的遗传分化距 离变化范围为0、0055～0．0426。以玉米为外类群，采用邻接法进行系统发育关系分析发现，同属于小麦族的大麦属植物、黑 麦和小麦 间亲缘关系较近 ，而水稻与玉米则相对较近 。 关键词：大麦属 ；叶绿体基因组；psbL；psbJ；序列分析 SequenceAnalysisofChloroplastpsbL andpsbJ GenesofSomeHordeum Speciesfrom China W EIYu—uring，YAN Ze—hong，W U Wei，GUO Hong，ZHANG Zhi—qing，ZHENG You—liang (TriticeaeResearchInstitute，SichuanAgriculturalUniversity，Dujiangyan611830) Abstract：ThepsbL—ps regionofchloroplastDNA (cpDNA)of8and2Hordeum speciesorsubspecies from Chinaandothercountries，respectively，wereinvestigatedbyPCR amplificationanddirectsequencing，It wasindicatedthatthelengthofthepsbL—psbJregioninallHordeum speciesorsubspecieswas365bp，andno variablesitewasobserved．ThesequencesofpsbL—ps regionwerecomparedwiththatofrye(Secalecereale L．)，wheat(Triticumaestivum L，)，rice(OryzasativaL．)andmaize(ZeamaysL．)．ThelengthofpsbL genewasll7bpinallmaterials，andnovariablesitewasdetected．ThelengthofpsbJgenewas123bpinall materials。andsixvariablesiteswerefound．ThelengthofpsblL—psbjinter—generegionwas125bpinallmate— rialsexceptrice．whileitwas126bpinrice．Therehave8variablesitesinpsbL—psbJinter—generegion．Using maizeasoutgroup，phylogeneticrelationshipswereestimatedbyneighbor—jioningmeth