从三维到五维：定量构效关系(QSAR)的研究进展.pdfVIP

维普资讯 中 国 药 科 大 学 学 报 586 JournalofChinaPharmaceuticalUniversity 2003，34(6)：586—591 · 综 述 · 从三维到五维 ：定量构效关系 (QSAR)的研究进展 李敏勇，夏 霖 (中国药科大学药物化学教研室，南京 210009) 摘【 要】本文综述了近年来定量构效关系的必威体育精装版发展，重点介绍了从三维定量构效关系至五维定量构效关 系的各种方法及应用 ，并就计算机辅助分子设计 中，定量构效关系所涉及的分子重叠和构象选择 问题进行 了初 步讨论。 【关键词】 定量构效关系；比较分子场分析法；偏最小二乘法；进展 【中图分类号】 R914 【文献标识码 】 A 【文章编号】 1000-5048(2003)06-0586-06 ShapeAnalysis，MSA)，从而揭开 了3DQSAR的序幕_lJ。3D- 1 前 言 QSAR的优势在于可 以克服传统 2D—QSAR的局 限性 ，并且 由于计算机软件 、硬件的迅速发展 ，特别是 80年代以 可 以直观地显现计算结果。分子形状分析后 ，又陆续 出现 来计算机图型工作站 (如 HP、SGI、SUN)的出现，为人们处理 了许 多 3D．QSAR方 法 ，如 Apex-3D[2l，距 离 几 何 学方 法 药物与受体的结构及药物与受体的相互作用提供了很好的 (DistanceGeometry，DG)l3J，比较分子 场分析法 (Comparative MolecularFieldAnalysis，CoMFA)[43等。其 中，在 3D-QSAR中 平台。人们可以利用这些新方法应用于计算机辅助药物设 计 ，并出现了新的计算机辅助药物设计方法 ，如 3D—QSAR， 最重要的进展是 1988年 Crameretal提 出的比较分子场分 析法 (CoMFA) 。coMFA的成功在于其将分子生物活性与 及 3D数据库有哪些信誉好的足球投注网站方法 、分子对接方法等。这些方法为新 其静电场和立体场联系起来 ，有关 CoMFA的综述较多，本 药设计 ，特别是先导化合物 的发现起了重要作用，并有了许 文不再重复 。 多成功的例子。这说 明了计算机辅助药物设计已经进入实 尽管 CoMFA取得了巨大的成功 ，它仍然存在缺陷。众 用化时代 ，其重要性已经被药物化学家所逐步认识 。 所周知 ，在构建 CoMFA模 型中最关键 ，也是最棘手 问题就 为了更好认识和利用这些研究成果 ，本文重点综述 了 是分子的排列 问题 (Alignment)，即分子与受体位点结合 的 近两年来从三维到五维 QSAR的必威体育精装版发展和应用 。 方 向。在这一关键步骤 中，任何小误差都将导致计算结果 2 31)-QSAR 的不理想。为了避免该 问题 的产生 ，人们陆续引入了许多