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2025年6月第42卷第6期广州中医药大学学报
June2025，Vol.42No.6JournalofGuangzhouUniversityofTraditionalChineseMedicine1485
三角草转录组测序及生物信息学分析
1，231，231，21，2
李静宇，戴亦亨，顾艳，罗栩强，梅瑜，王继华
（1.广东省农作遗传改良重点实验室广东省农业科学院作物研究所，广东广州510640；2.广东省道地南药资源保护与
利用工程中心，广东广州510640；3.中山市仙逸堂中药饮片有限公司，广东中山528436）
摘要：【目的】使用高通量测序技术研究三角草的转录表达情况。【方法】通过提取三角草的总RNA，进行文库构建、测序以
及denovo组装，得到单基因簇（unigene）序列，然后进行注释和比对，进而获得三角草转录组的遗传信息。【结果】共识别出
29325条unigene，平均长度为1026bp，N50为1697bp。其中，20338条unigene在至少一个数据库中获得了功能注释，三
角草与芦笋（Asparagusofficinalis）的序列最为相似。在京都基因与基因组百科全书（KEGG）数据库中，13392条unigene得到了
注释，包括黄酮合成通路和泛醌及其他萜烯类醌的生物合成等通路基因，鉴定出三角草皂苷合成的上游基因35个。在基因
本体论（GO）数据库中，16728条三角草unigene获得了注释，涵盖了细胞解剖实体、结合和生物过程等方面。通过微卫星鉴
定工具（MISA）对组装后的11486条长度超过1000bp的unigene进行了简单序列重复（SSR）检测，共鉴定出5178个SSR位
点，并使用Primer3.0进行引物设计。通过将三角草unigene与转录因子数据库比对，鉴定出bHLH、MYB和WRKY等转录因子
657个。【结论】转录组数据为三角草的药用活性成分合成通路及功能基因的研究提供了基础，也有助于其资源的保护和开发。
关键词：三角草；转录组；单基因簇；功能注释；简单重复序列
中图分类号：285文献标志码：A文章编号：1007-3213（2025）06-1485-07
DOI：10.13359/j.cnki.gzxbtcm.2025.06.027
TranscriptomeSequencingandBioinformaticsAnalysisof
HerbaChlorophytiLaxi
1，231，231，21，2
LIJingyu，DAIYiheng，GUYan，LUOXuqiang，MEIYu，WANGJihua
（1.KeyLaboratoryofCropGeneticImprovementofGuangdongProvince，CropResearchInstituteGuangdongAcademyofAgriculture
Sciences，Guangzhou510640Guangdong，China；2.GuangdongProvincialEngineeringTechnologyResearchCenterfor
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