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生物医学信息学 Biomedical Informatics “生物医学信息学”是计算机科学与生命科学和医学的交叉学科，是近几年在美国等发 达国家兴起的前沿学科。本课程的教学目的是使学生了解生物信息和医学信息技术在医疗卫 生行业中的应用，特别是在生物医学研究中的应用。提高学生的综合素质，满足大数据时代 生物医学教育的需求。主要讲授计算机技术在医学及医疗卫生领域的应用，其目的是使学生 了解基础医学研究及医疗卫生领域中所使用的多种计算机知识和技术，能够运用所学知识和 技能解决生物医学领域的实际问题。教学过程中坚持技术服务需求的核心理念，课程安排了 计算机技术在医学领域中应用的历史、现状、存在的问题、热点和技术难点等内容，课程以 专题形式进行，包括生物医学数据库、医学自然语言处理、医学数据挖掘、医学知识库、精 准医学的临床应用、序列比对、二代测序数据分析、疾病基因组、基因芯片数据分析、生物 网络分析和系统建模等等内容。课程除讲授各专题的基本概念以外，还向学生展示该领域的 应用实例，加深学生对课程内容的理解。 本课程计划与德克萨斯州立大学、 Mayo Clinic 、University of Missouri 和上海交 通大学联合授课，并邀请陶萃教授、刘宏芳教授、许东教授和吕晖教授来上海讲课。可将美 国在这一领域的必威体育精装版进展传授给学生。为复旦在这一新兴学科的建设打下一个基础。本课程 选用参考书目为Edward H. Shortliffe 编著的《Biomedical Informatics》和李霞主编的 《生物信息学》。 刘雷 研究员 复旦大学 liulei@ 刘雷，复旦大学生物医学研究院研究员，长期从事生物医学信息学 研究，发表SCI 论文60 余篇，取得软件著作权20 余项，申请专利 6 项。讲授过 “生物信息学”，“计算机辅助医学”等课程。正在 主持国家重点研发计划 “精准医学研究”专项“疾病研究精准医学 知识库构建”项目。 Hui Lu, Professor, Shanghai Jiao Tong University huilu@ Dr. Hui Lu is a Distinguished Professor and Head of the Department of Bioinformatics and Biostatistics, Shanghai Jiaotong University, the co-director of SJTU-Yale Joint Center for Biostatistics, and an adjunct professor of biostatistics of Yale University. He is also the Director of Center for Biomedical Informatics in Shanghai Children’s Hospital. He got Bachelor’s degree from Peking University and PhD from University of Illinois at Urbana-Champaign. After that, he joined University of Illinois at Chicago as a faculty in Bioinformatics and got tenure in 2008. His research areas include big data analysis in biomedical research, bioinformatics, biostatistics, molecular network modeling, systems biology, and drug design. His current research interests are in translational medicin