五种鲟鱼线粒体控制区异质性和系统发育分析.pdfVIP

动 物 学 研 究 2009，Oct. 30(5): 487−496 CN 53-1040/Q ISSN 0254-5853 Zoological Research DOI ：10.3724/SP.J.1141.2009.05487 五种鲟鱼线粒体控制区异质性和系统发育分析 * 王 巍，朱 华，胡红霞 ，田照辉，董 颖 （国家淡水渔业工程技术研究中心暨北京市水产科学研究所，北京 100068 ） 摘要：利用保守引物得到 5 种鲟鱼的线粒体 DNA （mtDNA ）控制区（D-loop ）全长，长度在795~813bp 。序 列中包括了 CBS （conserved sequence block ）和TAS （termination-associated sequence ）区域。利用最大似然法、 最大简约法和贝叶斯法构建了系统发育树，发育树分成两枝，呈现明显的生物地理分布。分析表明，现有的鳇属 鱼类不是单系群起源。5 种鲟鱼 D-loop 序列都存在长度和数目不等串联重复序列，长度在 78~82bp 之间，重复序 列拷贝数在 4~6 次不等，因此造成了 mtDNA 广泛的异质性现象。不同种类的重复序列单元十分相似，达氏鳇和 史氏鲟重复序列单元相似度为 82.93%，西伯利亚鲟和俄罗斯鲟重复序列单元相似度为 90.59% 。在串联重复序列 后是一段不完全重复序列。通过与已有同种的重复序列比对发现不同鲟鱼重复序列相同，不同地理区域相同物种 的重复序列可能发生过分子内重组。这些表明重复序列在鲟鱼进化上具有相关意义，推测重复序列可能产生在种 分化前，重组发生在种分化后。 关键词：线粒体控制区；西伯利亚鲟；史氏鲟；小体鲟；达氏鳇；俄罗斯鲟；重复序列；异质性 中图分类号：Q349.5 ；Q959.463 文献标识码：A 文章编号：0254-5853-(2009)05-0487-010 Heteroplasmy in mtDNA Control Region and Phylogenetics of Five Sturgeons * WANG Wei, ZHU Hua, HU Hong-xia , TIAN ZHAO-hui, DONG Ying （National Engineering Research Center for Freshwater Fisheries and Beijing Fisheries Research Institute, Beijing 100068, China） Abstract ：The sequences of the control region (D-loop) of mitochondrial DNA ( mtDNA) were obtained from five species of sturgeon. The sequences obtained had lengths between 795-813bp. The motifs of the conserved sequence block (CBS) and termination-associated sequence (TAS) were identified in the sequences. Examination of the molecular phylogeny using maximum likelihood, maximum parsimony an