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第41卷第1期 上海交通大学学报 V01．41No．1
OF UNIVERSITY Jan．2007
2007年1月 JOURNALSHANGHAIJIAOTONG
文章编号：1006—2467(2007)01—0042—03
彤一演算建模久噬菌体的生活周期
李 丹， 张敏， 董笑菊
(上海交通大学计算机科学与工程系，上海200240)
摘要：扩演算是一种描述生物蛋白质分子间相互作用的形式化语言．介绍了扩演算的语法、语义
以及A噬茵体侵蚀大肠杆菌细胞的生物过程，提出了用扩演算建模生物过程的一种方法，给出翻译
规则，并在规则的指导下建模具体的生物过程．根据模型的特点，分析和研究扩演算的表达能力和
表达特点．
关键词：扩演算；A噬茵体；生活周期；蛋白质
301．2
中图分类号：TP 文献标识码：A
彤一CalculusModelfortheL ofLambda
ife-Cycle Phage
LI ZHANG
Dan， Min，DONG
Xiao-j铭
Scienceand 200240，China)
(Dept．ofComputer Eng．，ShanghaiJiaotongUniv．，Shanghai
isaformal todescribethereactionsbetween molecules．This
Abstract：盯-calculus paper
language proteins
thesemanticsofx-calculus．the ofA theEsche—
introducedthe and eroding
syntax biologicalprocessphage
a of the onthe of
richiaColi(E．Coli)，andmethod study
proposed modelingbiologicalprocesses．Based
model。aseriesofruleswere andusedtomodelthe tothe
biological given process．According
ticsofthe also andstudiedtheabilitiesand ofthecalculus．
model，thepaperanalyzed properties
words：x-calculus；Aphage；life—cycle；protein
Key
用计算机科学理论中的模型形式化建模生物系 随着系统的演化，位点的状态发生变化，从而使蛋白
统是目前交叉研究的一个方向，其
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