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宿主vero细胞DNA残留量SOP
宿主vero细胞DNA残留量操作规程
试剂
(1)DNA标记和检测试剂盒
(2)TaKaRa universal Genomic DNA Extraction Kit ver3.0(DV811A)
(3 ) TaKaRa DNA Fragment Purification Kit(807A)
(4)DNA杂交膜: 尼龙膜
(5)2%蛋白酶K溶液:称取蛋白酶K0.20g,溶于灭菌水10ml中,分装后储存于-20℃备用。
(6) 3%牛血清白蛋白溶液 :称取牛血清白蛋白0.30g,溶于灭菌水10ml中。
(7) 1mol/l三羟甲基氨基甲烷(Tris)溶液(Ph8.0):用盐酸调pH至8.0。
(8) 5.0mol/l氯化钠溶液
(9)0.5mol/l乙二胺四乙酸二钠溶液(pH8.0)用10mol/l氢氧化钠溶液调节至8.0。
(10)20%十二烷基硫酸钠(SDS)溶液:用盐酸调pH至7.2。
(11)蛋白酶缓冲液(pH8.0)量取1mol/l Tris溶液1.0ml(pH8.0),5mol/l氯化钠溶液2.0ml,0.5mol/l乙二胺四乙酸二钠溶液(pH8.0)2.0ml,20%SDS溶液2.5ml,加灭菌水至10ml。
(12)TE缓冲液(Ph8.0)量取1mol/l Tris溶液10ml,0.5mol/l乙二胺四乙酸二钠溶液(pH8.0)2ml,加灭菌水至1000ml。
(13)1%鱼精DNA溶液:精密称取鱼精DNA0.10g,置10ml量瓶中,用TE缓冲液溶解并稀释至刻度,摇匀,用7号针头反复抽打以剪切DNA成为小分子,分装后贮藏于-20℃备用。
(14)DNA稀释液:取1%鱼精DNA溶液50μl,加TE缓冲液至10ml。
(15)washing buffer:0.1M 马来酸;0.15M氯化钠;0.3%Tween 20; PH7.5。
(16)马来酸溶液:0.1M 马来酸;0.15M氯化钠;PH7.5。
(17)检测液:0.1M Tris-Hcl;0.15M氯化钠;PH9.5。
一、用于标记探针和阳性对照的DNA制备
1.DNA的提取:用TaKaRa universal Genomic DNA Extraction Kit ver3.0(DV811A)试剂盒提取DNA。
2.测定DNA的吸光度:用TE将DNA稀释适当倍数,使DNA的A260值在为0.2-1.0之间(一般为40倍),然后在紫外分光光度计测定其波长在260nm和280nm的OD值,并且A260/ A280应在1.8-2.0之间。其含量(μg/ml)为:A260×50×稀释倍数。
3.酶切DNA:取DNA约1μg,用HaeⅢ酶(TaKaRa D1051A)酶切1小时,用1%琼脂糖凝胶电泳检测其片段大小是否被切开。
4.酶切反应液中DNA的回收:使用TaKaRa DNA Fragment Purification Kit(807A)回收酶切反应液中的DNA, 然后在紫外分光光度计测定其波长在260nm和280nm的OD值,并且A260/ A280应在1.8-2.0之间。其含量(μg/ml)为:A260×50×稀释倍数。
5.将上述4中回收的DNA作为阳性对照品,标明DNA浓度,分装于EP管中,-20℃以下保存。
二、探针的制备
1.取标准DNA约1μg加灭菌水至终体积16μl。
2.变性:沸水浴煮10min,立即冷却2min。
3.取Via1 4μl加到变性的DNA中,混合均匀,放入37℃温箱中放置过夜。
4.次日,取出3,向其中加入2.0μl 0.2M EDTA(PH8.0),2.5μl 3M(PH5.2) NaAc,冰无水乙醇75μl,-20℃放置2小时。
5.取出4,4℃ 12500rpm 离心15min,轻轻倒掉上清。
6.加入70%乙醇约150μl,缓慢晃动,4℃ 12500rpm 离心15min,弃掉上清。
7.室温晾干。
8. 加入50μl TE(PH8.0),吹打管底,放于-20℃保存,作为探针。
三、探针效力的检测Vial 2标准品,用稀释液将其稀释为10pg/ul、3 pg/ul、1 pg/ul、0.3 pg/ul、0.1 pg/ul、0.03 pg/ul、0.01 pg/ulul 点至尼龙膜上。
3.固定:将点样后的膜,放置干燥箱中,80℃ 2h 。
4.封底:在10ml中blocking solution(用马来酸溶液将Vial 6做10倍稀释,即blocking solution)中孵育30min。
5.加入酶结合物:在antibody solution(用blocking solution将Vial 4做5000倍稀释即antibody solution)中孵育30min。
6.洗膜:用10ml wash buffer洗2 遍,
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