稀杯盔形珊瑚铜锌超氧化物歧化酶基因全长cDNA序列的克隆与分析.pdfVIP

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2017-04-26 发布于未知
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热带海洋学报 JOURNAL OF TROPICAL OCEANOGRAPHY 2015 年第 34 卷第1期: 83?89 海洋生物学 doi:10.3969/j.issn.1009-5470.2015.01.012 稀杯盔形珊瑚铜锌超氧化物歧化酶基因全长 cDNA 序列的克隆与分析* 范程辉, 刘丽, 沈城, 郭昱嵩广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东省普通高校重点实验室广东湛江 524088 摘要: 利用反转录 PCR 和 RACE 法获得稀杯盔形珊瑚 Galaxea astreata 的铜锌超氧化物歧化酶(copper-zinc superoxide dismutase, CuZnSOD)基因 cDNA 全序列, 大小为 730 bp。5′非编译区(5′-UTR)为 111 bp, 3′-UTR 为 188 bp, 开放阅读框 (open reading frame, ORF)长度为 471bp, 编码 156 个氨基酸。编码的???的氨基酸序列中含有两个 CuZnSOD 蛋白家族信号, Cu2+分别与 His49、His51、His66 和 His123 配位, Zn2+则与 His66、His74、His83 和 Asp86 配位, Cys60 和 Cys149 之间形成唯一的链内二硫键。SignalP 3.0 Server 预测并未发现信号肽, TMHMM Server v. 2.0 预测不存在跨膜结构, PSORT II Prediction 预测位于细胞质的可能性为 56.5%, 推测可能是胞内 CuZnSOD。本研究结果为进一步揭示造礁石珊瑚的抗氧化分子机制奠定了基础。关键词: 铜锌超氧化物歧化酶; 基因克隆; 序列分析; 稀杯盔形珊瑚 Galaxea astreata 中图分类号: Q785 文献标识码: A 文章编号: 1009-5470(2015)01-0083-07 Molecular cloning and sequence analysis of the copper-zinc superoxide dismutase gene in Galaxea astreata FAN Cheng-hui, LIU Li, SHEN Cheng, GUO Yu-song Fisheries College, Guangdong Ocean University, Key Laboratory of Aquaculture in South China Sea for Aquatic Economic Animal of Guangdong Higher Education Institutes, Zhanjiang 524088, China Abstract: The full-length cDNA sequence of copper-zinc superoxide dismutase (CuZnSOD) gene was obtained from Galaxea astreata using RT-PCR and RACE methods. The results revealed that the full-length cDNA of CuZnSOD gene was 730 bp including 111 bp 5′-UTR, 188 bp 3′-UTR and 471 bp open reading frame (ORF) encoding 156 amino acids. The deduced amino acid sequence contained two CuZnSOD protein family s