鸡基因组差异表达基因翻译起始密码子上下游序列的比较研究.pdfVIP

第 ??卷 第 ?期? 生 物 信 息 学? ???．?????．?? ?????年 ???月? ?????????????????????????????????? ???．，????? ???：??．????／?．????．????— ????．????．??．??? 鸡 基 因组 差 异 表 达 基 因? 翻 译 起 始 密 码 子 上 下游 序 列 的 比较 研 究? 王樟凤 ，卓亮亮 ，黄子琦 ，柴学文 ，饶友生? ?南昌师范学院生物技术研究所 ，江西 南 昌，???????? 摘 要?翻译起始调控是基 因表达调控 的一个关 键步 骤之 一。本 文 以鸡为研 究材 料 ，比较研 究 了鸡基 因组 高表 达基 因和低 表? 达基 因翻译起 始密码子上下游的碱 基序列差异 ，旨在 寻找影响鸡基 因表达水平 的特异 性调 控位 点。全部 ?????个单剪接基 因? 完整 的 ????序列及有详细注释 的 ??????序 列从 ???????下载。编 写计算机程序 ，读取每 个基 因 ????起 始密码 子上下游? 各位 点的碱基 。研 究发 现，起始 密码子上游一?、一?位 点可 能是鸡 基 因组基 因表 达起始 密码 子正确识 别的关键 位点。起始 密? 码子上 下游 的碱基 组成分析 发现 ，高表达基 因和低表达基 因起 始密码子 的上游均倾 向使用 ?????，高表达基 因的使 用偏倚 尤? 为强 烈。序列差异 比较发现 ，高表达基 因在一?、一?、一?、??位点显著偏 向 ?，在 一?、一?、一?、一?位 点显著偏 向 ?。低表 达基 因起? 始 密码子上游使用 ?、?的频率 显著 高于低表 达基 因。在～??位 点强烈偏 向 ?，在??、???、???位 点强烈偏 向 ?。? 关键词 ：鸡 ；基 因表达调控 ；起始密码子 ；序 列差异? 中图分类号 ：????．?? 文献标志码 ：?? 文章 编号 ：????—??????????～??—???—??? ???????????????????????????????????????????????????????????