口蹄疫病毒(OS99株)VP1蛋白的空间构型和其可能抗原位点的初步分析.pdfVIP

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口蹄疫病毒(OS99株)VP1蛋白的空间构型和其可能抗原位点的初步分析.pdf

中国农学通报 2010,26(8):33-37 Chinese Agricultural Science Bulletin 口蹄疫病毒(OS/99株)VP1蛋白的空间构型和 其可能抗原位点的初步分析 刘靖清 1,王 君 1,周 兵 1,李 凯 2 (1盐城市畜牧兽医管理局,江苏盐城 224002;2中牧实业股份有限公司,北京 100070) 摘 要:试验研究了经 BHK-21 培养的口蹄疫病毒(FMDV)OS/99 株 VP1 蛋白的分子免疫学特征。通过 RT-PCR 得到 FMDV 的 VP1 基因序列,应用分子生物学软件对其蛋白序列的空间构型和抗原性进行分 析。通过对其β-折叠数量、亲水性、抗原指数、可塑性、表面可能的抗原性参数的综合分析,得出OS/99株 VP1 蛋白中可能含有多个抗原位点,具有较强的抗原覆盖性。抗原位点可能位于 22-29、43-46、82-85、 92-93、100-111、134-139、154-156、180-184 和 196-203 位氨基酸残基区域内。毒株经过 BHK-21 细胞培养 13代后,其蛋白空间构型未发生明显变化。 关键词:口蹄疫病毒;VP1蛋白;抗原性 中图分类号:S852.65 文献标志码:A 论文编号:2009-2415 Research of the Spatial Arrange and its Possible Antigenic Sites in VP1 Protein of FMDV from OS/99 Strain Liu Jingqing1, Wang Jun1, Zhou Bing1, Li Kai2 ( Yancheng Jiangsu 224002; 1Administration of Husbandry and Veterinary of Yancheng prefectures in Jiangsu Province, , Beijing 100070) 2China Animal Husbandry Industry Co., LTD The aim of our experiment was to investigate molecular immunological characters of VP1 in Abstract: foot-and-mouth disease virus from OS/99 viral strain cultured in BHK-21 cells. In this study, the sequence of VP1, which was isolated through RT-PCR, was analyzed in DNAStar software to obtain its spatial arrange and antigenicity. The result of this research indicated that the VP1 from OS/99 might contain many antigenic sites in terms of some parameters on the antigenicity, which located in 22-29, 43-46, 82-85, 92-93, 100-111, 134-139, 154-156, 180-184 and 196-203 amino acid regions. For that the virus strain of os/99

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