杜仲基因组微卫星特征及SSR标记开发.pdfVIP

林业科学研究2015，28(3)：387～393 11堡墼堡墼!堡丝 文章编号：1001—1498《2015)03旬387_07 杜仲基因组微卫星特征及SSR标记开发 腾k2 吴 敏1’2，杜红岩1’2如，乌云塔娜1’2…，刘攀峰1’2…，荆 (1．中国林业科学研究院经济林研究开发中心，河南郑州450003；2．国家林业局杜仲工程技术研究中心，河南郑州450003； 3．国家林业局泡桐研究开发中心，河南郑州450003) 摘要：为全面解读杜仲的遗传背景，本研究在基因组测序(数据未公布)的基础上，通过MIsA软件有哪些信誉好的足球投注网站杜仲基因组 947／854758160 694个sca肋Ids含有488 (26 bp)中的完整型(1～7核苷酸重复)及复合型ssR序列，共查找出25 749 592个ssR位点，占总sca胁lds的95．3％。从ssR位点分布密度上讲，平均每1bp出现1个微卫星，其中单核 苷酸重复单元的ssR含量最多，约占总数的54．34％，其次为二核苷酸(20．47％)，而复合模式、三核苷酸、四核苷 均以含A、T的重复类型占主导地位。根据ssR位点设计并合成引物290对，162对ssR引物扩增出清晰的目的条 带，其中16对引物多态性高、稳定性好，在8份杜仲资源中共检测到84个等位基因，平均每个ssR位点检测到5．25 个等位基因。本研究对于进一步利用ssR分子标记分析杜仲遗传多样性、遗传图谱构建、杜仲雌雄株早期鉴定等具 有较高的应用价值。 关毽词：杜仲；基因组；ssR；标记开发；多态性 中图分类号：s718．46 文献标识码：A ofGenomicMicrosatellitesand of Ch8racterization DeVelopment SSRMarkersof砌cDmm施H西氍D洫s 形U胁n1一，Du舶凡g．弘n1’2’3，形啪，Ⅳ死眦1’2’3，ⅡuP口n母n91’2’3，朋VG扎愕1，2 R＆D of (1．Non—timberForestryCenter，Chinese 450003，He’nan，China； AcademyFores‘ry，Zhengzllou 0fstafe 2．Eucommia Researchcen￡er F0res时AdmiIl主s￡ratj册，Zheng小ou450003，He’nan，Chi舳； En矛needng 3．PaulowniaR＆DCenter0f ofState China 45()003，He’nan，China) ForestryAolministmtior，Zhen铲hou on ofE础^0mmio nucleotide Abstract：Based genome uZmo￡ak，theped．ectSSR(1～7 repeats)and sequencing f而m SSR weresearched