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日本血吸虫抑制素 生物信息学分析 G15： 马帅 夏天奇 李莎 塔娜 报告内容： 研究背景 编码区核酸序列分析 蛋白序列分析 总结与致谢 研究背景 • 东方田鼠是迄今由我国学者在血吸虫病疫 区发现的唯一一种感染日本血吸虫后不致 病的哺乳动物。因此东方田鼠是日本血吸 虫的抗性宿主，东方田鼠血清特异识别的 蛋白可能会对虫体的生长发育有影响。 • 经过筛选，抑制素能被东方田鼠的血清特 异识别，因此对其进行生物信息学分析具 有重要实用意义。 核酸序列分析 利用RT-PCR方法，克隆出的日本血吸虫抑制素编码 区序列及注释信息如下: 核酸序列分析 密码子使用 用WebLab 中cusp(v6.0.1) 软件分析编码区的密 码子使用： 核酸序列分析 限制位点分析 • 用restrict(v6.0.1)软件分析该基因序列 中的限制性核酸内切酶位点，分别把 限制位点的长度限制为4 、6、和8 bp 时，其中限制位点的个数则为698个、 130个、23个。我们对这个基因序列进 行操作时要考虑这些限制位点，以防 止破坏读码框；也便于根据实验室常 用酶使用特定限制位点。 蛋白序列分析 理化性质 利用WebLab 中pepstats(v6.0.1) 和ExPASY网站ProtParam软件分析 蛋白序列分析 • 利用pepwindow(v6.0.1) 软件对抑制素进行疏 水性亲水性分析 氨基酸分值越低 亲水性强，分值 越高疏水性越强。 此蛋白序列亲水 性得分比较均， 且亲水疏水分布 均匀。 在机体内，疏水 性残基一般埋在 蛋白质内部，而 亲水性残基位于 表面，蛋白质的 亲水部位与蛋白 抗原表位也有密