Pharmacophore Modeling and in Silico Screening Studies to Design Potential KDR Kinase Inhibitors.pdfVIP

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Pharmacophore Modeling and in Silico Screening Studies to Design Potential KDR Kinase Inhibitors.pdf

FULLPAPER PharmacophoreModelingandinSilicoScreeningStudiesto DesignPotentialKDR KinaseInhibitors xu,Dan(徐丹) Sun,Haopeng(孙昊鹏) Chen,Yadong。(陈亚东) Sun,Liping (孙丽萍) You,Qidong,。(尤启冬) DepartmentofMedicinalChemistry,ChinaPharmaceuticalUniversity,Nanjing,Jiangsu210009,China SchoolofPharmacy,ChinaPharmaceuticalUniversiyt,Nanjing,Jiangs“210009,Chinn A novelligand—basedpharmacophoremodelforKDRkinasewasgeneratedonthebasisofchemicalfeaturesof 30KDRkinaseinhibitors.Thispharmacophoremodelconsistsofonehydrogen—bondacceptoronehyrdogen—bond , donorandtwohyrdophobicgroups.Severalmehtodshavebeenusedtovalidatethemodel , suggestinghtatitcan serveasareliabletoo1forvirtualscreeningtofacilitatethediscoveryofnovelKDRinhibitors . Themodelwasthen usedasdatabasesearchquery from hteNationalCancerInstitute(NCI)databaseofrtherationaldesigntoidentify new hitcompound. Keywords anticancer,KDRkinaseinhibitor,molecularmodeling virtualscreening , Introduction In orderto gain furtherinsightinto the structural requirementsofKDR inhibitorsofrdurgdesign.anovel vascularendothelialgrowthfactor(VEGF1isapo— ligand—basedpharmacophoremodelwasdevelopedand tentmitogen produced by cellsthat s

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