PCRDGGE法在慢性胃炎病人舌苔菌群结构研究中的应用.pdfVIP

第 l5卷 第 2期 生命科 学研 究 V01．15 No．2 2011年 4月 LifeScienceResearch Apr．2011 PCR—DGGE法在慢性 胃炎病人舌苔茵群结构研究 中的应用 张红琳 12，田凯旋 ，周 东蕊 ，杜彩贺 ，张仁敏 ，陆祖宏 (1．东南大学 生物与医学工程学院，中国江苏 南京 210093； 2．南京晓庄学院生物化 与环境丁程学院，中国江苏 南京 211171) 摘 要 ：在 早间未刷 牙和进食 的情 况下，刮取 胃炎病 人与正常人舌 苔，去除杂质 ，分 离菌体 ，采用酚 ／氯仿 法 抽提 细菌基 因组 DNA，并对其 中 16SrDNA V3可 变区进行 聚合 酶链 式反应 (PCR)扩增和 变性梯度凝胶 电泳 fDGGE1测 定．用 Bionumerics软件 对 DGGE分子指纹 图谱进行舌苔茵群结构相似性分析．实验 结果表 明，采用 该方法成功地扩增 出 l6SrDNAV3区片段 ．为 230bp．DGGE分子指纹 图谱结果表 明．正常人 的舌苔茵群最 高相似性为 0．74．胃炎病人 的舌苔 菌群 的最 高相似性 为 O．52，正常人 的舌苔茵群与 胃炎病人的舌苔菌群 相似 性最 高为 0．38．即胃炎病人舌苔菌群结构发 生了变化． 关键词 ：胃炎；舌苔 ：16SrDNA：茵群结构 中图分类号：Q9331 文献标识码 ：A 文章编号：l007—7847(2叭1)O2—0125一O4 ApplicationofPCR-DGGE intheAnalysisofStructureofBacteria Colonyfrom TongueCoatinginGastritisPatients ZHANG Hong一1in，2 TIAN Kai—xuan ，ZHOU Dong．rui，DU Cai—he， ZHANG Ren—min ．LU Zu—hong (1．CollegeofBiologicalScienceandMedicalEngineering，SoutheastUniversit)，Nanjing210009，Jiangsu，China； 2．DepartmentofBiochemicalEngineeringandEnvironmentalEngineering，NanjingXiaozhunagCollege，Nanjing211171， J／na~,：su，China) Abstract：Tonguecoatingofgastritispatientand normalpersonswerescrapedwithoutcleaningteeth and nofood in themorning．Impuritieswereeliminated andthebacteriawasseparated．Thetotalmicrobial genomeDNA ofeachsamplewasextractedbyphenol—chloroform ，V3regionsof 16SrDNA wasamplified with PCR，andPCR productswereanalyzedbyDGGE．Thesimilarity ofbacteriastructurewasanalyzed withBionumerics．TheresultshowedthatV3regionsof16SrDNA wasextracted，230bp．DGGE suggested thatthehighestsimilaritywas0．74innormalpersons，thatofgastritispatientswas0．52，andthatofnormal personsand gastritispatientswas0．38．Therefore，somevar