利用基因芯片筛选大肠癌中细胞增殖相关基因.pdfVIP

维普资讯 山西医科大学学报 (JShan硒 7n2 QQ墨生 (Z · 585 · 文章编号 ： 1007—6611(2008)07—0585—03 利用基因芯片筛选大肠癌中细胞增殖相关基因 刘志荣， 李美宁， 王惠珍， 张悦红， 牛 勃，程牛亮 (山西医科大学生物化学与分子生物学教研室， 太原 030001； 通讯作者，E-mail：chengniuliangty@yahoo．tom．ne) 摘要： 目的 用基因芯片技术筛选大肠癌中细胞增殖相关基因。 方法 利用HG-U133Plus2．0基因芯片，对大肠癌组织 和正常组织基因表达谱进行检测 ，并利用生物信息学方法对检测结果进行分析。 结果 ①癌组织与正常组织比较 ，表达差 异2倍以上基因共有 1200个，其中表达上调的474个 ，表达下调的726个。②在 1200个基因中，共有 127个基因与细胞的 增殖功能相关 ，其中表达上调的66个 ，表达下调的61个。 结论 127个细胞增殖相关基因可为大肠癌的基因治疗提供靶 点。 关键词： 基因芯片； 大肠肿瘤 ； 细胞增殖相关基因 中图分类号： R735．34 文献标识码： A Screeningthecell·proliferation·associatedgenesexpressedincolorectalcancerbygenechips LIUZhi—rnog，LIMei—ning，WANGHui—zhen，ZHANGYue-hong，NIU I3o，CHENGNiu—liang (DeptofBiochemistryand MolecularBiology，Shan：ciMedicalUniversity，Taiyuan030001，China；*Correspondingauthor，E-mail：chengniuliangty@ yahoo．∞m．CTI) Abstract： Objective Tosl2reenthecell—proliferation-ass~iatedgenesexpressedincolorcetalcancerbygneechips． Methods TheHG-U133Plus2．0gneechipswereusedtonaalyzegeneexpressionprofiles ofcolorectaladenoacrcinomanadnormaltissues．The resultswereanalyzedbybioinformatictechniques． Results Comparde withnormaltissues，aottalof1200genes withmorethan 2-folddifferentialexpressionweredetcetde inadenocarcinomatissues，ofwhich，474nad726geneswereup-regulatde naddown-regu— latde ，respcetively．Amongthe1200genes，127genes wererelevanttothebiologiaclprocessof cellproliferation，of which，66gnees wereup-regulatde and61genes weredown—regulatde ． Conclusion Theresultssuggestthat127cdl—proliferation—associatde genes xepressedineolorcetalcancermi曲the thetargetsofgenetherapy． Keywords： genechips； eolorcetalneoplasms； cell—proliferation-associatde genes 本研究采用基因芯片技术观察正常大肠黏膜 1．2 方法 组织和癌组织之间的基因表达差异 ，并利用生物信 1．2．1 样品制备 用 Trizol试剂 (Invitrogen公司， 息学方法筛选大肠癌中细胞增殖相关基因，探讨肿