基于线粒体COI基因序列的棘头梅童鱼7个野生群体遗传结构分析.pdfVIP

中国水产科学 2015年3月，22(2)：233—242 JournalofFisherySciencesofChina 研 究论文 DoI：10．3724／SP．J．1118．2015．14218 基于线粒体COI基因序列的棘头梅童鱼7个野生群体遗传结构分析 赵明L2，宋炜 ，马春艳 ，张凤英 ，蒋科技 ，宋志明一，马凌波 1．农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室，中国水产科学研究院 东海水产研究所，上海 200090； 2．上海海洋大学 水产与生命学院，上海 201306 摘要：利用线粒体 COI序列为遗传标记分析 了棘头梅童鱼(ColIichthyslucidusRichardson)7个地理群体(江苏连云 港、江苏大丰、上海崇明、浙江舟山、浙江温州 、福建宁德和福建厦门)的遗传结构特征 。在 7个群体209个样本 的线粒体 COI序列中共检测到44种单倍型 。7个群体单倍型多样性为(0．41640．112)～(0．720i0．076)，核苷酸多样性 为(O．00110~0．00035)-(0．00444~0．00164)。两个组群的 AMOVA 分析显示，南北两个组群分析组群间的变异为 40．10％(P0．01)，组群间群体间的为一0．15％ (尸0．05)，群体内为60．05％ (尸0．05)，这与基于单倍型构建的NJ树、 基于群体间遗传距离构建的 UPGMA 树的结果均表明棘头梅童鱼群体具有明显的谱系结构，以温州为分界点，温 州以北为北方类群，以南则为南方类群 。两群体之间的基因流数据表明南方与北方类群 的基因交流受阻，结合各方 面资料，推测更新世的演化历史因素为棘头梅童鱼南北分支形成的主要原因，而 自身的生活习性则是南、北类群内 部无明显分化的原因。其结果可以为合理开发和利用棘头梅童鱼野生资源，以及建立和保护棘头梅童鱼种质资源 提供必要的参考 。 关键词：棘头梅童鱼；COJ，基因；遗传结构；遗传多样性 中图分类号：$972．1 文献标志码：A 文章编号：1005—8737一(2015)02—0233—10 棘头梅童鱼 (CollichthyslucidusRichardson) 德锋等 郴】、林能锋等 、殷丽娜 叫和Song ] 属鲈形 目(Perciformes)，石首鱼科(Sciaenidae)，梅 分别采用 AFLP、线粒体控制区、微卫星等为标 童鱼属，是温水性 、近底层的小型经济海水鱼类。 记对中国沿海棘头梅童鱼群体遗传多样性进行了 其肉鲜嫩、味美，为中国沿海居民喜食的主要冰 初步报道 。 鲜水产品之一[1]。近年来，随着传统主要经济鱼 鱼类线粒体 DNA fmtDNA)同其他许多脊椎 类资源的衰减，棘头梅童鱼已成为中国近海渔业 动物一样，为共价闭合环状双链 DNA分子，遵循 的主要捕捞对象之一。目前的捕捞利用现状不利 严格的母系遗传，几乎不发生重组，不同区域的 于棘头梅童鱼资源的正常维持，国内已有中国水 进化速度存在差异，因此被广泛用于探讨种群遗 产科学研究院东海水产研究所、上海水产研究所等 传结构或有机体变异历史2【引。细胞色素氧化酶亚 科研单位正在开展棘头梅童鱼人工繁育技术研究。 基 I(CO I)为线粒体 13个蛋白编码基因中研究的 迄今为止对棘头梅童鱼的研究多集中在资源 最为清楚的基因之一，由于COI的进化速率与线 评估 一l、进化分析[7-11及人工繁殖 等方面， 粒体的其他序列如 D。loop、Cytb等相比较低，被 在其遗传多样性及遗传分化等方面的研究中仅郑 广泛用于鱼类系统发育及 DNA条形码的研究2【引， 收稿 日期：2014．05．16；修订 日期 ：2014．07．10． 基金项 目：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(东2012M06)；水产种质资源平 (2014DKA30470)；公益性行业 (农业)科研专项(201303047)． 作者简介：赵H~(1989-)，男，硕士研究生，主要从事海水鱼类遗传多样性研究．E．mail：tomorrow333@126．tom 通信作者：马凌波，研究员．E—mail：malingbo@vip．sina．to