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基于图像的微阵列生物芯片分析.pdf
25卷6期 中 国 生物 医学 工程学报 V01.25No.6
2006年12月 ChineseJournalBiomedical December2006
of Engineering
基于图像的微阵列生物芯片分析
段会龙” 邓 宁
(浙江大学生物医学工程与仪器科学学院,教育部生物医学工程重点实验室,杭州 310027)
摘要:利用生物芯片的高通量特性,系统地研究生物体基因和蛋白质表达及其相互作用,在最近十几年迅速发
展。以图像为基础的生物芯片分析是生物芯片技术的重要组成部分,对其方法进行研究已成为当前的热点之一。
目前很多针对生物芯片的分析方法不断涌现,这些方法涉及网格定位、靶点分割、数据提取和表达、几何校正、噪声
消除等生物芯片分析子过程。本研究对以上各类分析方法进行了综述,分析了各类方法的不同应用,比较了多种
算法的分析结果,并提出当前在生物芯片分析研究领域需要解决的关键问题。
关键词:生物芯片;图像分割;自动网格定位;投影算法;表达分析
A on
SurveyImage-basedMicroarrayAnalysis
DUAN
Hui—Long。DENGNing
Biomedical andInstrument Biomedical
(Collegeof Engtneering Science,The研Laboratoryof Engineering
in 310027)
MinistryofEducation,ZhejiangUniversity,Hangzhou
are toolsforthe of and
Abstract:Microarraysrevolutionaryhigh·throughput studygene proteomicsexpressions.7IMs
hasbeen advancedinrecent isan of
technology rapidly analysis importantaspectmieroarray
years.Image—based
hot
canhavea on andthereforebecomestheresearch
experiments,whichpotentiallylargeimpactsubsequentanalyses
of methodsusedOil datahavebeen
spot.Numbersanalysis microarray issued,including
extractionand andSOon.Inthis classesof based
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