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肝胆胰外科杂志
第卷第期
376Vol.37No.6
年月JournalofHepatopancreatobiliarySurgery
20256Jun.2025
·论著基础研究·
胰腺导管腺癌微生物亚型分析揭示肿瘤
微环境异质性
麻忠武,彭明晖,林泉,管时伟,张凯伦,俞海波
温州医科大学定理临床学院/温州市中心医院肝胆胰外科,浙江温州325000
[摘要]目的探究胰腺导管腺癌(PDAC)微生物亚型及其与宿主基因组、肿瘤微环境的相互作用。
方法整合来源于GEO数据库的PDAC转录组数据和来源于BioProject数据库的PDAC宏基因组数据,通
过非负矩阵分解(NMF)聚类确定PDAC肿瘤微生物亚型,对各亚型微生物组及转录组进行差异分析;采
用生存分析确定有预后意义的微生物。采用免疫浸润分析对各亚型对应的肿瘤微环境进行对比,并采用
加权基因共表达网络分析(WGCNA)解析共表达网络中微生物基因组互作。结果数据库分析显示,
-
PDAC微生物可分为C1[威克斯氏菌科(Weeksellaceae)为主]、C2[鞘脂单胞菌科(Sphingomonadaceae)为
Pseudomonadaceaeα
主]、C3[假单胞菌科()为主]三种亚型,其中C3亚型多样性最高但患者预后相对较差。
C3亚型中抗菌通路异常激活,且肿瘤微环境呈现出免疫抑制的特征。WGCNA揭示短波单胞菌属与肿瘤
基因组互作最显著,涉及氧化代谢、PI3K/AKT等通路。结论本生物信息学研究表明,PDAC微生物各
亚型的异质性通过调控宿主基因组及免疫微环境影响肿瘤进展,C3亚型的高多样性与不良预后特征提示
其作为潜在治疗靶点的价值。
[关键词]胰腺导管腺癌;肿瘤微生物;肿瘤微环境;宿主-微生物互作;非负矩阵分解;加权基因共表
达网络分析
[中图分类号] [文献标识码]
R735.9Adoi:10.11952/j.issn.1007-1954.2025.06.008
Intratumoralmicrobialsubtypinginpancreaticductaladenocarcinomarevealstumor
microenvironmentheterogeneityMAZhongwu,PENGMinghui,LINQuan,GUANShiwei,ZHANG
Kailun,YUHaibo.DepartmentofHepatobiliaryandPancreaticSurgery,WenzhouCentralHospital/Dingli
ClinicalCollegeofWenzhouMedicalUniversity,Wenzhou,Zhejiang325000,China
AbstractObjectiveToexplorethemicrobialsubtypesofpancreaticductaladenocarcinoma(PDAC)and
theirinteractionswiththehostgenomeandtumormicroenvironment.MethodsPDACtranscriptomedata
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