基于miRNA-mRNA调控网络分析并验证易损斑块形成的潜在分子机制.pdfVIP

·824·广东医学2024年7月第45卷第7期GuangdongMedicalJournalJul.2024,Vol.45,No.

基于miRNA-mRNA调控网络分析并验证易损

斑块形成的潜在分子机制

张晓璐，葛为勇²，曾文赞”，于群4，王一婧”，姜希娟

1天津中医药大学中西医结合学院（天津301617)；²滨海慢性病防控与健康创新研究院（天津300461）；赣州市

人民医院肿瘤科（江西赣州341000）；遵义医科大学基础医学院（贵州遵义563000）；天津中医药大学护理学院

（天津301617)

【摘要】目的分析并验证易损动脉粥样硬化（atherosclerosis，AS）斑块形成的潜在分子机制。方法

通过形态学染色验证主动脉根和头臂干中是否存在AS斑块。采用GSE34646和CSE34647数据集中的差异

表达miRNA(differentiallyexpressedmiRNAs，DEMs）分析并预测DEMs靶基因（DEMs-targetgenes，DEMs-

TGs）。其次，筛选CSE10000数据集易损斑块中差异表达基因（differentiallyexpressedgenesinadvanced

plaque，DEGs-AP)。然后将DEGs-AP与DEMs-TG进行交集，以筛选候选基因。对获得的基因构建PPI

网络，并鉴定关键基因。接着建立miRNA-mRNA调控网络，并使用受试者工作特征（ROS）曲线评估关键基

因的预后。最后采用RT-qPCR检测主动脉中预测的mRNA和miRNA水平。结果组织病理学检查显示，

模型组有明显的易损斑块。通过CSE34646和GSE34647数据集筛选，在易损斑块中获得44个DEM，并预测

得到3171个和8075个miRNA靶基因。在GSE10000数据集中，获得了3441个DEGs-AP。然后将DEGs-

AP和DEMs-TG交集,得到936个候选基因。PPI网络鉴定了10个上调和10个下调的枢纽基因，用于构建

miRNA-mRNA调控网络。结论Let-7g-3p-ADAM10/PIK3R1/C3AR1可能是RT-qPCR预测和诊断晚

期斑块的潜在miRNA-mRNA调控轴。

动脉粥样硬化；miRNA；易损斑块；生物信息学

【关键词】

【中图分类号】R541.4;R543.1A

【文献标志码】

D0I:10.13820/ki.gdyx

smsofvulnerableplaqueformationbasedonmiRNA-mRNA

alidationofpotentialmolecularmechanismsofvulnerablepla

Analysisandv

regulatorynetwork.ZHANGXiao-lu,GEWei-yong,ZENGWen-yun,YUQun,WANGYi-jing,JIANGXi-

juan.*SchoolofIntegrativeMedicine,TianjinUniversityofTraditionalChineseMedicine,Tianjin301617,China

Co

respondingauthor:JIANGXi-juan.Jxj2668@tjutcm.edu.cn

[Abstract]ObjectiveToanalyzeandvalidatethepotentialmolecularmechanismsinvolvedintheformationof

vulnerableatherosclerosisplaquesthroughthemiRNA-mRNAregulatorynetwork.MethodsMorphologicalstaining

wasusedtovalidatethepresenceofatherosc