加权基因共表达网络分析结肠癌免疫相关生物标志物.pdfVIP

国际医药卫生导报2024年4月第30卷第7期IMHGN,April2024,Vol.30,No.7·1079·

加权基因共表达网络分析结肠癌免疫相关

生物标志物

王苗苗张睿哲徐磊武寒吴淑华

滨州医学院附属医院病理科，滨州256600

通信作者：吴淑华，Email：wsh6108126.com

【摘要】目的旨在鉴定可能参与结肠癌发生发展的免疫相关预后基因，采用加权基因共表达

网络对癌症基因组图谱（TCGA）和基因表达综合数据库（GEO）联合分析，筛选免疫生物标志物。方

法2022年11月至12月，对GSE41657数据集和TCGA结肠癌数据集中免疫相关基因进行加权基因

共表达网络分析，并从关键模块筛选免疫相关生物标志物，利用TCGA数据库中基因表达数据和临床

信息进一步分析。结果获得了结肠癌发生发展中与免疫相关的最关键模块，其功能富集到免疫细

胞趋化、游走、活化、增殖、迁徙等，通路富集到趋化因子信号通路、抗原处理和呈递、MAPK信号通路、

HIF-1信号通路、PI3K-Akt信号通路、NF-kappaB信号通路等。找到了有望作为结肠癌预后靶点的

10个基因：NMB、SCG2、IL1A、ULBP2、INHBB、COLEC12、F2RL1、ANGPTL1、NR3C2、TNFRSF17。通过

TIMER数据库筛选出2个与结肠癌免疫相关性最为密切的基因——COLEC12、ANGPTL1，这两个基因

富集到诸多免疫相关和癌症相关通路——JAKStat信号通路、Toll样受体信号通路、MAPK信号通路

等，可能在肿瘤免疫微环境中发挥重要作用。结论COLEC12、ANGPTL1可能通过多种信号通路对

结肠癌及其免疫微环境进行调控，有望成为潜在的免疫治疗靶点。

【关键词】结肠癌；加权基因共表达网络；免疫相关生物标志物；癌症基因组图谱；基因

表达综合数据库

基金项目：国家自然科学基金

Weightedgenecoexpressionnetworkanalysisonimmune-relatedbiomarkersincolon

cancer

WangMiaomiao,ZhangRuizhe,XuLei,WuHan,WuShuhua

DepartmentofPathology,BinzhouMedicalUniversityHospital,Binzhou256600,China

Correspondingauthor:WuShuhua,Email:wsh6108@126.com

【Abstract】ObjectiveToidentifytheimmune-relatedprognosticgenesthatmaybe

involvedinthedevelopmentandprogressionofcoloncancer,andtoscreentheimmunebiomarkers

analyzingthedatafromTheCancerGenomeAtlas(TCGA)andGeneExpressionOmnibusdatabase

(GEO)byweightedgeneco-expressionnetwork.MethodsThestudywasfromNovemberto

December2022.Theweightedgenecoexpressionnetworkanalysiswasperformedon

immune-relatedgenesinGSE41657andTCGAdatasetsforcoloncancer,andtheimmune-related

biomarkerswerescreenedfromkeymodules.Thegeneexpressiondataa