‘湘辣14号’辣椒叶绿体全基因组特征及进化关系分析.pdfVIP

栽培生理中国果菜第44卷,第12期

CultivationPhysiologyChinaFruitVegetable2024年12月

‘湘辣14号’辣椒叶绿体全基组特征及

进化关系分析

1111321*

何刀山，何海燕，谢维，罗治国，张铁军，秦雅林，李鹏

（1.湘潭市农业科学研究所，湖南湘潭411134；2.湖南人文科技学院农业与生物技术学院，湖南娄底417000；

3.湘潭市雨湖区响水乡农业中心，湖南湘潭411134）

摘要以‘湘辣号’辣椒幼嫩叶片为材料，采用平台对其进行测序，获得‘湘辣号’叶绿体

院14IlluminaNovaSeq600014

全基因组序列，利用生物信息学对‘湘辣号’叶绿体基因组结构特征、重复序列、密码子使用偏性、边界、核苷酸多样

14IR

性以及进化关系进行分析。结果表明，‘湘辣号’叶绿体基因组全长为，为典型的四分体结构，总含量为

14156817bpGC

。共注释个基因，包括个蛋白编码基因、个基因、个基因。在‘湘辣号’叶绿体基因组中

37.72%132878rRNA37tRNA14

鉴定到个分散重复序列和个简单重复序列（，）位点，其中单核苷酸重复最多，主要以

61190simplesequencerepeatSSR

为主，占总数量的。密码子分析表明，‘湘辣号’叶绿体基因组密码子第三位碱基偏向使用。区

A/TSSR53.16%14A/UIR

相对和更为保守，部分基因存在收缩和扩张现象。共在‘湘辣号’叶绿体基因组中获得个高变异区：

LSCSSC145

。进化关系分析说明，‘湘辣号’与辣椒（）和（）的

14.OP919650.1.JX27081.1

亲缘关系较近，属于辣椒属植物。本研究为‘