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生物技术通报
·研究报告·BIOTECHNOLOGYBULLETIN2025,41(2):187-201
基于转录组分析植物激素对洋葱鳞茎膨大发育的调控
机制
李艳伟杨妍妍孙亚玲�霍雨猛五王振宝刘冰江
(山东省农业科学院蔬菜研究所农业农村部黄淮设施园艺工程重点实验室山东省大宗露地蔬菜育种重点实验室,济南250100)
摘要:【目的】通过对洋葱发育不同阶段的鳞茎组织进行转录组比较分析,为研究植物激素在洋葱鳞茎形成过程中的分
子调控机制提供依据。【方法】分别取洋葱出苗后33、47、61和75d的鳞茎部位为试验材料,通过酶联免疫吸附法和气相色谱法
检测,了解生长素、细胞分裂素、赤霉素3、脱落酸以及乙烯(前体ACC)含量在鳞茎膨大过程中的变化趋势;利用高通量测序技
术进行转录组测序分析,从分子水平阐述植物激素对鳞茎发育的影响。【结果】从4个发育阶段的鳞茎中共检测到11814个差异表
达基因(DEGs),其中共同DEGs有3311个;KEGG富集分析显示,不同发育阶段比较组DEGs均显著富集到“植物激素信号转
导”通路,并对该通路上筛选到的36个主要DEGs进行表征;结合WCCNA分析每个模块与性状的r和P值,筛选到2个关键模块,
通过转录因子预测,挖掘到3028个转录因子unigenes与13个植物激素信号结构基因unigenes共表达,转录因子unigenes功能注释
来自46个基因家族,最多的为锌指蛋白(C,C2、C,H),其次为bHLH、NAC、ERF基因家族。【结论】通过转录组分析揭示了植物
激素信号转导途径参与洋葱鳞茎膨大发育的相关基因。
关键词:洋葱;鳞茎膨大;转录组分析;植物激素;转录因子
DOI:10.13560/ki.biotech.bull.1985.2024-0671
RegulationMechanismofPlantHormonesRelatedtoOnionBulb
EnlargementandDevelopmentBasedonTranscriptomeAnalysis
LIYan-weiYANGYan-yanSUNYa-lingHUOYu-mengWANGZhen-baoLIUBing-jiang
(InstituteofVegetables,ShandongAcademyofAgriculturalSciences,MinistryofAgricultureandRuralAffairsKeyLaboratoryofHuangHuaiProtected
HorticultureEngineering,ShandongKeyLaboratoryofBulkOpen-fieldVegetableBreeding,Jinan250100)
Abstract:[Objective
basisforstudyingthemolecularmechanismofplanthormonesinonion(AlliumcepaL.)bulbformation.
and75dafterseedlingemergencewerecollectedasexperimentalmaterials.ELISAandgaschromatographywereusedtoquantifythecontents
ofauxin,cytokinin,gibberellin3,abscisicacidandethylene(precursorACC)duringthebulbenlargementanddevelopment.Transcriptome
sequencingwasperformedusinghigh-throughputsequencingtechnologytoelucidatetheeffectsofplanthormonesonbulbdevelopmentat
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