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RobustRankAggreg(RRA)整合四个GSE数据集的差异基因要分几步走?
你还在为找不到课题方案而焦虑吗,复现一篇论文吧!
你还在为找不到研究思路而苦恼吗,复现一篇论文吧!
你还在为找不到数据方法而悔恨吗,复现一篇论文吧!
预计阅读时间3分钟
“
刚来的小伙伴不要慌了哈,小助理选的一直是同一篇论文
只不过用的是不同方法进行复现
一千种方法练一次
不如一种方法练一千次
进步的第一步就是敲下文章里面的代码
”
想要知道分几步走继续看下去,以下就是复现过程,跟着文章走,他山之石可以攻玉,没准儿一不小心你就会了呢?
论文来源:
文章目录:
四个GSE数据集差异表达基因(按logFC值排序)并为一个list,正序倒序各一个list
所有差异基因在四个GSE数据集中logFC矩阵
筛选共同上调基因
筛选共同下调基因
合并共同上下调基因
logFC.tiff
四个GSE数据集差异表达基因(按logFC值排序)并为一个list,正序倒序各一个list
所有差异基因在四个GSE数据集中logFC矩阵
筛选共同上调基因
筛选共同下调基因
logFC.tiff
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