第三章 基因与基因组PPT.ppt

5 核糖体结合位点 SD（Shine-dalgarno sequence）序列，是原核生物基因翻译起始位点周围的一组特殊的序列，控制着基因的翻译过程。SD序列位于mRNA的5`非翻译区，起始密码子之前10个碱基内，包含一个嘌呤六聚体AGGAGG的一部分或全部。SD序列可与16SrRNA3`端CCUCCU结合，是mRNA与核糖体结合的序列，与翻译复合物的形成和翻译的起始有关。 真核生物基因结构 外显子 内含子 3`非编码区 加polyA区 终止密码子 内含子边界3`AG 内含子边界5`GT 信号肽序列 起始密码子 5`非编码区 5`加冒位点 TATA盒 GC盒 CAAT盒 第三节 真核生物基因组 一 基因组与C值 一个物种单倍体染色体所携带的一套基因称为该物种的基因组（genome）。 每一种生物的单倍体基因组的DNA总量称为C值。不同的物种的C值差异极大，一般来讲，随物种生物结构和功能的复杂程度增加，需要的基因数目和基因产物的种类越多，C值应越大。 C值矛盾 C值的大小与物种的结构组成和功能复杂性没有严格的对应关系，这种现象成为C值矛盾（C-value paradox） 形态学上的复杂程度与C-值不一致的现象又称为C-值悖理。 每门类中DNA最小量Phylum Species Genome(bp) 　 藻类 Pyrenomas salina 6.6×105 支原体 M.pneumoniae 1.0×106 细菌 E.coli 4.2×106 酵母 S.cerevisiae 1.3×107 霉菌 D.discoideum 5.4×107 线虫 C.elegans 8.0×107 昆虫 D.melanogaster 1.4×108 两栖动物 X.laevis 3.1×109 哺乳动物 H.sapiens 3.3×109 以每门类中DNA最小量作图 二 单一序列 基因组中只有一个或几个拷贝的DNA序列称为单一序列（unique sequence）又称非重复序列 （nonrepetitive sequence）。原核生物基因组中除了短片段反向重复序列及16S、23S 、5SrRNA和tRNA外，借为单一序列。真核生物的单一序列所占比例为40~70%。不是所有单一序列都编码多肽链的结构基因，真核生物基因组只有很少的单一序列 编码多肽链，大部分为非编码的间隔序列，但大多数结构基因是单一序列。　 三重复序列 真核生物基因组存在许多重复序列（repetitive sequence）。这些重复序列成簇或分散分布于基因组中。 基因组中，不止一个拷贝的序列称为重复序列。 包括高度重复序列、中度重复序列和低度重复序列。 1 ．中度重复序列：占基因组的25-40%，分散于基因组。短分散重复序列和长分散重复序列。 短分散重复序列 短分散重复序列（short interspersed repeated sequence，SINEs）重复单位长度为300~500bp，拷贝数105以上。 人类和哺乳动物的短分散重复序列Alu家族（Alu family）序列长300bp，有2个130bp的重复序列，中间有31bp的间隔序列。每个Alu序列含有一个限制性内切酶AluⅠ的识别序列AGCT，可被AluⅠ切割为170bp和130bp两段。Alu家族占人类基因组的3-6%，单倍体基因组中约有30~50万个拷贝。是人类基因组最丰富的中度重复序列。 中度重复序列 长分散重复序列（long interspersed repeated sequence）重复单位长度5000~7000bp，重复次数102~105 。 人的KpnⅠ家族占基因组3~6%，300~4800个拷贝，重复单位用限制性内切酶KpnⅠ酶切，得到1.2、1.5、1.8和1.9kb的DNA片段。 哺乳动物LINE1家族，有RNA聚合酶Ⅱ转录，基因组中约有66万个拷贝，重复单位长读6500bp，属一种转座因子。 2 高度重复序列 在基因组中的重复次数106~108，重复单位的碱基组成2~200bp。 有些高度重复序列含有异常高或低的GC，当基因组DNA被切成数百个碱基对的片段进行氯化铯密度梯度离心时，由于重复序列片段的GC