hlab27基因亚型及非mhc基因多态性与强直性脊柱炎遗传易感性的关联分析-association analysis of hlab 27 gene subtype and non - mhc gene polymorphism with genetic susceptibility of ankylosing spondylitis.docx

缩写英文全称中文全称GWASGenome-wideassociationstudy全基因组关联分析SNPSinglenucleotidepolymorphism单核苷酸多态性ASAnkylosingspondylitis强直性脊柱炎MHCMajorhistocompatibilitycomplex主要组织相容性复合体LDLinkagedisequilibrium连锁不平衡HWEHardy-Weinbergequilibrium哈德-温伯格平衡HLAHumanleukocyteantigen人类白细胞抗原ANTXR2Anthraxtoxinreceptor2炭疽毒素受体2TNFAIP3Tumornecrosisfactor,alpha-inducedprotein3肿瘤坏死因子α诱导蛋白3ERAP1Endoplasmicreticulumaminopeptidase1内质网氨基肽酶1BpBasepair碱基对kbkilobase千碱基DNAdeoxyribonucleicacid脱氧核糖核酸PCRpolymerasechainreaction聚合酶链式反应SSPsequencespecificprimer序列特异性引物RT-PCRRealtime-polymerasechainreaction实时定量-聚合酶链式反应MAFminorallelefrequence次要等位频率CMP-2capillarymorphogenesisprotein-2毛细管生成蛋白2SPSSStatisticalpackageofsocialscience社会科学统计软件包OROddsratio优势比CIConfidenceinterval可信区间PPvalueP值cSNPcodingsinglenucleotidepolymorphism编码SNPTBETris-borate-EDTAbufferTris-硼酸缓冲液中文摘要HLA-B27基因亚型及非MHC基因多态性与强直性脊柱炎遗传易感性的关联研究研究背景：强直性脊柱炎（ankylosingspondylitis，AS）是一种常见的以侵犯骶髂关节和脊柱为主要特征的慢性炎症性疾病，可导致患者关节畸形、残疾，最终丧失劳动能力，并严重影响患者的生存质量。该病具有高度的遗传性，遗传度大于90%。在我国AS的患病率为0.3%，发病高峰20-30岁，男女比例约10:1。由于其发病机制尚不明确，至今仍无有效的治疗措施，所以对其发病机制的揭示就成为有效治疗AS的亟待解决的难题和研究重点。鉴于AS的高度遗传性特征，近年来AS全基因组关联性研究（genome-wideassociationstudy，GWAS）得以蓬勃开展，研究发现除主要组织相容性复合体（Majorhistocompatibilitycomplex，MHC）与其呈强关联外，许多非MHC基因区域也被证实与AS有关联，诸如IL23R、ERAP1、IL1R2、ANTXR2等，这使得AS的遗传易感性研究获得了重大进展。但是目前的研究大都局限于在不同人群的大宗病例对照中筛选并获得AS的关联性基因位点，而对其在AS发生与发展中的生物学功能的研究却涉及甚少。因此有必要对已发现的AS易感性遗传变异区段进行更加精细的定位并对有意义的关联性多态性位点进行功能性研究。目的：通过对北方汉族人群HLA-B27基因多态性与AS关联性的研究，对非MHC基因多态性中的ANTXR2、TNFAIP3和ERAP1进行SNP精细分型并对其生物学功能进行初步探讨，以及对与HLA-B27抗原加工与提呈功能相关的ERAP1基因多态性间相互作用的综合分析，深入揭示HLA-B27基因亚型及非MHC基因多态性与强直性脊柱炎遗传易感性的关联及在AS遗传学发病机制中的作用。方法：1.本研究采用病例对照研究来探讨HLA-B27基因多态性与AS的关联性。共筛选到602例AS病例和与之匹配的598例健康无关对照，所有AS病例的诊断都符合1984年修订的纽约标准。HLA-B27基因多态性分析采用PCR-SSP方法。B27基因多态性频率在病例对照中的比较以及不同地区间分布的比较，都采用皮尔森?2检验（SPSS13.0软件）。当理论数5时，使用Fisher确切概率法检验。.本研究通过病例对照研究来精细定位与AS遗传易感性相关的非MHC基因多态性位点并对其生物学功能进行初步研究。我们筛选了619例健康无关个体作为对照组，他们在性别、年龄以及地域分布上与上述602例AS病例相匹配。在ANTXR2基因中筛选到19个tagSNPs，TNFAIP3中为6个，ERAP1中有4个，并采用SequenomiPlex平台和连接酶检测反应方法进行tagSNPs分型。本研究采用流式细胞术来研究不同tagSNP基因型对CMP-2蛋白表达的影响