hiv1 蛋白酶与抑制剂相互作用的理论研究-theoretical study on the interaction between hiv - 1 protease and inhibitor.docx

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hiv1 蛋白酶与抑制剂相互作用的理论研究-theoretical study on the interaction between hiv - 1 protease and inhibitor

独创声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得(注:如没有其他需要特别声明的,本栏可空)或其他教育机构的学位或证书使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名:导师签字:学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅。本人授权学校可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。(必威体育官网网址的学位论文在解密后适用本授权书)学位论文作者签名:导师签字:签字日期:20年月日签字日期:20年月日目录中文摘要..........................................................................................................................................IAbstract.........................................................................................................................................Ⅳ第一章HIV-1蛋白酶(PR)与抑制剂(PIs)的相互作用概述1HIV-111.1.1HIV-1形态与结构21.1.2HIV-1的生命周期3HIV-1PR5PR的结构5PR的功能6PR的作用机制酶的作用机制...............................................................................................PR的作用机制8PIs9PIs的种类91.3.1PIs的功能111.4PR与PIs的相互作用111.4.1库仑形式的静电相互作用..................................................................................121.4.2范德华相互作用..................................................................................................121.4.3氢键相互作用......................................................................................................131.4.4疏水相互作用......................................................................................................13第二章理论与方法.....................................................................................................................152.1量子化学计算......................................................................................................152.1.1从头算法.....................................................................................................粒子坐标的初始化..........................................................................2.1重新加氢.................................................................................30.2加入中和离子.........................................................................30.3选择溶剂模型..............................

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