大肠杆菌F18菌株敏感和抵抗基因型仔猪十二指肠基因表达谱-生物通.PDFVIP

HEREDITAS (Beijing) 2011 年 ISSN 0253-9772 大肠杆菌F18 菌株敏感和抵抗基因型仔猪十二指肠基 因表达谱差异分析比较 1,3,4 1 1 1 2 1 3,4 包文斌 ，叶兰 ，潘章源 ，朱璟 ，杜子栋 ，蔡家嘉 ，黄小国 ，朱 国强 2,3,4 ；吴圣龙 1,3,4 1. 扬州大学动物科学与技术学院，扬州 225009 ； 2. 扬州大学兽医学院，扬州 225009 ； 3. 江苏省现代种猪分子选育工程技术研究中心，常州 213149 ； 4. 江苏（扬州）规模猪场高效健康养殖公共技术服务中心，扬州 225009 摘要：文章运用Agilent 双标记表达谱芯片，基于已建立的苏太猪大肠杆菌 F18 菌株敏感性和抗性型全同 胞配对个体，分析十二指肠组织基因表达谱差异，旨在筛选导致仔猪断奶后腹泻和水肿病发生的大肠杆菌 F18 菌株受体相关基因，探讨造成大肠杆菌病抗性和敏感性资源家系抗性差异的分子生物学机理。研究结 果显示，以Fold change 绝对值大于2 倍进行筛选，在敏感型（GG 基因型）对抗性型(AA 基因型)配对组中， 差异基因共13 个，其中上调6 个，下调7 个，在以敏感型（AG 基因型）对抗性型(AA 基因型)配对组中， 共筛选出差异基因6 个，其中上调4 个，下调2 个。经GO 分析发现差异基因的生物学过程主要涉及免疫 应答、胞外区修饰（如糖基化）、细胞黏附、信号转导等。通路发现大肠杆菌F18 菌株抵抗性和敏感性差异 基因主要涉及糖脂合成代谢以及炎症免疫相关通路，经芯片筛选出的相关基因的功能还需进一步的研究验 证。 关键词：猪；大肠杆菌F18 菌株；基因芯片；基因表达谱 cDNA microarray on differently expressed genes in duodenum in porcine sensitive or resistant to Escherichia coli F18 1,3,4 1 1 1 2 1 BAO Wen-Bin , YE Lan , PAN Zhang-Yuan , ZHU Jing , DU Zhi-Dong , CAI Jia- Jia , HUANG Xiao-Guo3,4, ZHU Guo-Qian2,3,4, WU Sheng-Long1,3,4* 1. Animal Science and Technology College, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China; 2. College of Veterinary Medicine, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China; 3. Jiangsu Engineering Research Centre for Molecular Breeding of Breeder Pig, Changzhou 213149, China; 4. Jiangsu (Yangzhou) Public Technical Service Centre for Efficient and Healthy Culture Technology in Large-scale Swine Farms, Yangzhou 225009, China Abstract: Based on the paired full-sib individuals selected from the established resource populations of Sutai pig that were characterized as resistant or sensitive to ETEC F18, Agilent double labeled cDNA microarray was used 收稿日期：2010-06-11 ；修回日期：2010-09-14 基金项目：国家自然科学基金项目（编号），转基因生物新品种培育科技重大