猪nlrc5基因克隆及序列特征分析-西南民族大学学报自然科学版.pdfVIP

２０１６年１月 西南民族大学学报(自然科学版) Ｊａｎ２０１６ 第４２卷第１期 Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｓｏｕｔｈｗｅｓｔ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｆｏｒ Ｎａｔｉｏｎａｌｉｔｉｅｓ(Ｎａｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｅｄｉｔｉｏｎ) Ｖｏｌ４２ Ｎｏ１ 第１期 杨琦玥ꎬ等:猪ＮＬＲＣ５基因克隆及序列特征分析　　　　　 ｄｏｉ:１０１１９２０/ ｘｎｍｄｚｋ２０１６０１００６ 猪 ＮＬＲＣ５基因克隆及序列特征分析 １ １ ２ １ ２ 杨琦玥 ꎬ陈通 ꎬ李键 ꎬ黄勇 ꎬ兰道亮 (１ 西南民族大学生命科学与技术学院ꎬ四川　 成都　 ６１００４１ꎻ２ 西南民族大学青藏高原研究院ꎬ四川　 成都　 ６１００４１) 摘　 要:为了解猪天然免疫受体ＮＬＲＣ５基因特征ꎬ用人类、小鼠等物种ＮＬＲＣ５基因已知片段设计分段扩增的引物ꎬ同时 运用ＲＡＣＥ技术ꎬ克隆该序列并进行序列生物信息学分析.基因序列分析表明ꎬ克隆得到猪ＮＬＲＣ５基因ｃＤＮＡ 全长为 ６６３８ｂｐꎬ基因开放阅读框为５５３８ｂｐꎬ共编码１８４６个氨基酸.蛋白质预测结果显示ꎬＮＬＲＣ５编码蛋白质整体表现为亲水性ꎬ 蛋白质结构域分析结果显示ꎬＮＬＲＣ５具有典型的ＮＡＣＨＴ 区及２０ 个ＬＲＲｓ.同源性分析表明猪与牛、绵羊、猕猴、人等物种 具有较高同源性ꎬ达到了８０％左右ꎬ遗传进化树分析表明与牛和绵羊进化关系最近.进一步组织表达分析表明ＮＬＲＣ５基 因除在淋巴结、脾脏等系统免疫器官中具有较高表达量ꎬ在肠淋巴结、胃、肺等黏膜器官中也有较高的转录水平.本研究结 果说明猪ＮＬＲＣ５基因在长期进化中较为保守ꎬ尤其在哺乳动物间具有较高的保守性ꎬ在免疫反应中可能扮演着重要的角 色.猪ＮＬＲＣ５基因序列的成功克隆为后续ＮＬＲＣ５在机体内免疫系统中的功能研究奠定了理论基础. 关键词:ＮＬＲＣ５基因ꎻ猪ꎻ基因克隆ꎻ序列分析 中图分类号:Ｑ７　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 文献标志码:Ａ　 　 　 　 　 　 　 　 　 文章编号:２０９５￣４２７１(２０１６)０１￣００３９￣０８ Ｃｌｏｎｉｎｇ ａｎｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ＮＬＲＣ５ ｇｅｎｅ ｆｒｏｍ ｐｉｇｓ １ １ ２ １ ２ ＹＡＮＧ Ｑｉ￣ｙｕｅ ꎬＣＨＥＮ Ｔｏｎｇ ꎬＬＩ Ｊｉａｎ ꎬＨＵＡＮＧ Ｙｏｎｇ ꎬＬＡＮ Ｄａｏ￣ｌｉａｎｇ (１Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ ＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙꎬＳｏｕｔｈｗｅｓｔ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｆｏｒ ＮａｔｉｏｎａｌｉｔｉｅｓꎬＣｈｅｎｇｄｕ６１００４１ꎬＰＲＣ ꎻ ２Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｑｉｎｇｈａｉ－Ｔｉｂｅｔａｎ ＰｌａｔｅａｕꎬＳｏｕｔｈｗｅｓｔ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｆｏｒ ＮａｔｉｏｎａｌｉｔｉｅｓꎬＣｈｅｎｇｄｕ６１００４１ꎬＰＲＣ ) Ａｂｓｔｒａｃｔ:Ｉｎ ｏｒｄｅｒ ｔｏ ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅ ｔｈｅ ｇｅｎｅｔｉｃ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ ＮＬＲＣ５ ｉｎ ｉｎｎａｔｅ ｉｍｍｕｎｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ｏｆ Ｓｕｓ ｓｃｒｏｆａꎬｔｈｉｓ ｒｅｓｅａｒｃｈ ｄｅｓｉｇｎｅｄ ｐｒｉｍｅｒｓ ｂｙ ｕｓｉｎｇ ｔｈｅ ｋｎｏｗｎ ｇｅｎｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ ＮＬＲＣ５ ｆｒｏｍ ｈｕｍａｎ ａｎｄ ｍｉｃｅＴｈｉｓ ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｌｓｏ ａｐｐｌｉｅｄ ＲＡＣＥ ｔｅｃｈ￣ ｎｅｑｕｅ ｔｏｃｌｏｎｅｔｈｉｓｓｅｑｕｅｎｃｅａｎｄｃｏｎｄｕｃｔ