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2018-11-27 发布于天津
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服务：数据驱动的基因组分析与解读陈钢 CTO@WeGene 个人基因组为用户做什么？目录我们在阿里云生态中的实践 content 未来的基因组数据平台一、个人基因组为用户做什么？ WeGene ：基因组数据 Fitbit ：运动数据若饭：定量饮食 Quantified Self ！二、我们在阿里云中的实践数据存储 RDS ：预处理后的基因组数据，表型数据，网站数据 OSS ：基因组原始数据，大型的计算结果：全基因组数据：FASTQ ，BAM ，约每用户200GB ，约50用户芯片数据：CEL ，约每用户200MB ，约7000用户 GeneDock ：正在处理的全基因组数据和芯片数据本地存储：所有数据的备份数据传输 • 芯片数据：实验室用OSS客户端上传OSS • 全基因组数据：通过GeneDock的专线上传GeneDock系统 • 23andme等数据：通过API直接存储RDS 计算 • 本地服务器： • 主要用于研发，或者是处于alpha测试阶段的产品，Celery调度 • 基于Spark的芯片数据质控 • ECS ： • 实时的小规模计算，例如简单的遗传风险评估； • 常规Web服务 • GeneDock ： • 全基因组数据分析三、未来基因组数据的二次分析统计分析，机器学习，数据可视化全基因组数据存储、分析和可视化 Genomics API ，上层应用，标准化亚洲人群的Genome Graph 参考数据集，自学习系统，开放服务