耐辐射异常球菌irrE基因增强细胞耐盐能力的研究-abc.PDF

耐辐射异常球菌irrE基因增强细 胞耐盐能力的研究 任课老师：罗静初 教授 组员：王丹霞、刘盈盈、刘妍、赵玉兰 报告人：刘盈盈 组号：G10 单位：生物技术研究所，CAAS 主要内容 1 研究背景 2 生物信息学分析 3 生理生化实验结果 4 展望 全球土壤环境盐碱化严峻 高盐是一种主要的非生物胁迫因素， 严重影响农作物的产量和品质。 抗盐特性研究 抗逆转录因子成 为研究热点 耐盐基因新资源 耐辐射异常球菌(Deinococcus radiodurans) 革兰氏阳性球菌 1956年分离 培养物为红色 二分体或四分体形式 无孢子形成 无致病性 主要内容 1 研究背景 2 生物信息学分析 3 生理生化实验结果 4 展望 1999年完成耐辐射异常球菌全基因组测序; 其基因组含有2个染色体2个质粒; 预测含有3187个ORF IrrE 蛋白序列相似性分析 Kira S. Makarova et al., 1999, MICROBIOL. MOL. BIOL. REV. irrE是耐辐射球菌中重要的DNA 修复保护途径开关基因 Katsuya Satoh, Microbiology, 2006 DR_0167在染色体上的位置 irrE基因的研究进展 DR菌一号染色体上显示DR0167的位置 EARL ET AL. JOURNAL OF BACTERIOLOGY, Nov. 2002 多序列比对 Ｎ端 Ｃ端 构建irrE蛋白系统发育进化树 IrrE蛋白结构域 Zn-PROTEASE HTH-Domain PEST Domain Domain 1-115aa 116-124aa 125-180aa 181-198aa 199-2 18aa 2 19-233aa 234-328aa Guanjun Gao, 2005 沙漠异常球菌IrrE 蛋白晶体结构(Vujicic-Zagar et al., 2009) (a) IrrE 结构立体示意图；(b) IrrE 蛋白的表面电势 • IrrE 蛋白是异常球菌属特异蛋白。对 IrrE 蛋白的氨基酸序列进行BLASTp 比 对分析，结果显示，IrrE 蛋白由3 个模 体（motif）组成。其中包括1 个锌离 子依赖型多肽酶模体 （1-162 位氨基 酸），1 个螺