不同地理群体三疣梭子蟹mtDNA本底甲基化水平分析.pdfVIP

第39卷第2期 海 洋 渔业 V01．39，No．2 2017年03月 Malinetrmheri髂 Mar．，2017 文章编号：1004—2490(2017)02—0190一07 不同地理群体三疣梭子蟹mtDNA 本底甲基化水平分析 闻奋亮1，王银海1，赵莲1，赖晓芳1’2…，阎斌伦1’2…，高焕1’2’3 (1．淮海工学院海洋生命与水产学院，江苏省海洋生物技术重点实验室，连云港222005； 2．江苏省海洋资源开发研究院，连云港222001；3．江苏省农业种质资源保护 与利用平台，南京210014) 摘要：利用重亚硫酸盐测序法，对适于三疣梭子蟹(Portunustrituberculatus)线粒体基因组甲基化分析的 BSP(BisulfitesequencingPCR)引物进行了筛选，在设计的2l对引物中，获得了12对BSP引物。利用这12对 引物分析了三疣梭子蟹海州湾群体(江苏连云港)和莱州湾群体(山东东营)线粒体基因组本底甲基化水平， 结果表明：海州湾群体不存在甲基化现象，菜州湾群体发现了2个个体在ND2基因(NADH脱氢酶亚基2)位 点存在甲基化现象；在存在甲基化的个体中，甲基化类型主要为CHG和CHH类型，还有少量CpG类型。该 研究结果说明，莱州湾群体和海州湾群体线粒体基因组本底水平上的甲基化特征存在一定差异，相关研究值 得进一步深入探讨。 关键词：三疣梭子蟹；线粒体基因组；甲基化；地理群体 中图分类号：S965．199 文献标识码：A 表观遗传学阐释了内在遗传物质和环境互 三疣梭子蟹(Portunus 作的关系，因不断有新的发现被报道，因此一直 黄渤海沿海地区最重要的经济蟹类之一，关于其 是生命科学研究的热点之一¨J。表观遗传的主 种质资源的研究一直受到广泛的关注M一7|。按照 要机制包括DNA甲基化、核染色质修饰、基因组 地理分布情况，三疣梭子蟹通常被划分成不同的 印记及非编码microRNA变化等旧j，其中DNA甲地理群体，如舟山群体、海州湾群体、莱州湾群体 基化是从细菌到高等生物都普遍存在的表观修 等旧1。有学者认为，莱州湾群体是一个比较特殊 饰现象[3J。DNA甲基化是指生物体在DNA甲基的群体，几乎是封闭在莱州湾内，与其它群体基 转移酶(DNMT)的催化下，以S一腺苷甲硫氨酸因交流的机会很少，而舟山和海州湾自然群体间 则存在着比较广泛的基因交流一。1…。目前，这些 (SAM)为甲基供体，将甲基转移到特定碱基上的 过程。4]。DNA甲基化与基因表达密切相关，其通不同地理群体遗传特征的研究方法主要是采用 过与反式作用因子相互作用或通过改变染色质 核基因组序列标记¨1-12]、线粒体序列标记n3-14] 结构而影响表达，在细胞分化、发育、x染色体失 等方法展开的，这些不同的技术方法多角度反映 活、基因组印记及肿瘤发生中都起着重要的作 出三疣梭子蟹不同地理群体的遗传差异特征，但 用‘5|。 一直未见表观遗传学特征差异方面的文献报道。 收稿日期：2016—06—15 (D2014—17)；江苏省高校“青蓝工程”培养基金 作者简介： 闻奋亮(1993一)，男，2012级水产养殖学专业本科生，主要从事甲壳类遗传学研究。 E—mail：451460713@qq．eom 通讯作者： 高焕，副教授。E-mail：huanmr@163．eom 第2期 闻奋亮等：不同地理群体三疣梭子蟹mtDNA本底甲基化水平分析 191 本文对莱州湾和海州湾两个地理群体线粒体基 PCR扩增，扩增体系为25“L(5斗LEpiMark 10mM 因组本