一种基于监督降维和形状分析的基因选择方法.pdfVIP

2011年6月 西安电子科技大学学报(自然科学版) Jun．201l I姗RSnY V01．38No．3 第38卷第3期 。硕瓜NAI，oFⅫ姒N 1．03．019 doi：10．3969／j．issn．1001-2400．201 一种基于监督降维和形状分析的基因选择方法 耿耀君，张军英 (西安电子科技大学计算机学院，陕西西安710071) 摘要：因为由主分量分析与形状分析相结合的基因选择方法没有有效利用样本的类别信息，所以提出 了一种新的基因选择方法，将间隔最大化判别分析和形状分析相结合，在选择基因过程中不仅考虑了基 因与基因之间的相互作用，也考虑了基因与类之间的相互关系，提高了所选基因集的分类性能．对4组 微阵列基因表达数据的实验表明，该方法的性能优于主分量分析与形状分析相结合的方法，与当前两个 流行的多变量Filter方法相比，也具有一定的优势． 关键词：基因选择；微阵列数据；Procrustes分析；问隔最大化判别分析 中图分类号：TP391文献标识码：A 文章编号：iool-2400(2011)03-0121-07 Geneselectionmethodbasedon dimensionreduction supervised and procrustesanalysis GENG Junying Yaojun，ZHANG of Scienceand Univ．，Xi’an (SchoolComputer Technology，Xidian710071，China) Abstract：Theselectionmetllodwhichcombines witll does gene principalcomponentanalysisshapeanalysis not usetheclassinformationon atthis new selectionmetllod effectively samples．Aimingshortcoming，agene discriminantwith is inthis Inthe combiningmarginmaximizing analysisshapeanalysispresentedpaper． gene selection newmethodconsidersnot theinteractionbetweenbutalsothe process，the only genes relationship betweenandclass theclassification ofselected genes label，whichimpmves performance genes．Experimental resultsonfour datashowthatthe ofthe methodis to microarraygeneexpression performancepresen