李立明《流行病学》19 分子流行病学.pptVIP

单核苷酸多态性（SNPs） (遗传多样性) Genetic Diversity 第三节 主要研究方法 研究设计和分析 主要的研究方法 研究设计与实施 资料处理与分析 生物标本的采集 生物标志的选择和检测 生物标志的选择 生物标志的检测 实验中的质量控制 主要的研究方法 病例对照研究 病例-病例研究 巢式病例对照研究 研究设计和分析 研究设计与实施 研究目的 调查方法与样本 测量指标 测量方法 结果与分析 质量控制 注意事项 资料处理与分析 传统流行病学指标分析 疾病率、暴露率、比值比OR和 相对危险度RR.... 基因多态性与疾病关联研究分析 通过分析目标等位基因和基因型频率在病例组和对照组中分布的差异，判断基因多态性是否与疾病风险存在关联。 基因-环境交互作用分析 表16-2 XRCC1 TC多态性与肺癌易感性 XRCC1(TC) 基因型 病例组(710例) 对照组(710例) 粗OR (95%CI) No % No % TT 500 70.4 558 78.6 1.00 CT 198 27.9 148 20.9 1.49(1.17~1.91) CC 12 1.7 4 0.5 3.55(1.07~10.45) CT/CC vs TT (显性模型) - - - - 1.54(1.21~1.96) CC vs CT/TT (隐性模型) - - - - 3.03(0.97~9.45) 相加模型 - - - - 1.54(1.23~1.93) （Hu et al, 2005) 个体 易感性 基因－环境交互作用 环境 暴露 人群 表16-3 病例对照研究基因环境交互作用分析* 基因 暴露 因素 病例 对照 OR - - a b OR00 =1.00 - + c d OR01=cb/ad + - e f OR10=eb/af + + g h OR11=gb/ah * 1-暴露，0-非暴露。OR10为基因的主效应，OR01为环境的主效应，OR11为环境-基因的联合作用，交互作用的相对比值比ORint可由公式 ORint = OR11 /（ OR01 × OR10）计算获得。 生物标本的采集和储存 生物标本：包括病原和人体的生物标本。常用的有：微生物标本、血液（血清）标本、组织标本、其他生物标本。 要求：在采集和储存过程中不能受到“污染”，所有的生物标本都应有详细的背景材料和鉴别标识。 生物标志的选择 生物标志选择的原则 生物标志应特异、稳定 标本采集、储存方便 检测方法比较简单、实用，而且操作规范，便于与同类研究结果比较 检测方法灵敏度和特异度高 暴露指标：最好能代表接触剂量或生物作用剂量。 效应指标：最早期生物效应标志、结构和功能改变、临床诊断标志。 易感性指标：传染病：一般选择抗体水平等作为易感性指标；慢性非传染病一般选择易感基因及其表达产物等作为易感性标志。 生物标志的检测 生物标志的特性 分子特性 时相特性 个体内变异 个体间变异 群体间变异 储存变异 生物标志物的检测方法 核酸研究技术（DNA RNA） 核酸体外扩增 核酸电泳图谱 核酸酶切电泳图谱 核酸分子杂交 蛋白质研究技术 凝胶电泳、蛋白质转印杂交、色谱分析、蛋白质测序等。 酶学技术 包括定性和定量检测，要求一定的条件。多位点酶电泳法 其它技术 免疫学技术、色谱技术、生物芯片技术等。 DNA测序 液相色谱 核酸分子杂交 蛋白质电泳 酶联免疫吸附 SNP 检测技术 凝胶时代： 主要技术和方法 ：限制性片段酶切多态性（RFLP），单链构象多态性（SSCP），寡核苷酸连接分析（OLA）等。 高通量时代： 按技术原理分 ：特异位点杂交（ASH），特异位点引物延伸（ASPE），特异位点切割（ASC）和特异位点连接（ASL）等。 * Illumina高通量基因分型平台 实验中的质量控制 一般实验质量控制 标本采集和储存 试剂和材料 仪器 实验方法 操作规范 设立对照 标准对照 空白对照 重复对照 重复试验 实验室内重复试验 实验室间重复试验 第四节 应用与展望 传染病的预防与控制 慢性非传染性疾病的预防与控制 健康风险评估与预测 展望 传染病的预防与控制 病原体的分离和检测 病原生物进化变异规律研究 传染源追踪 确定传播途径 传染病防制措施及其效果评价 慢性非传染性疾病的预防与控制 探索疾病的病因及发病机制 评估个体易感性和确定高危人群 慢性病防制措施的制定及其效果评价 辅助疾