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PCR染色体DNA提取
PCR、染色体DNA提取 选择题 1.关于PCR扩增停滞的原因有很多种,但下列各项中(B)项不是主要原因。 A.底物(模板)过剩 B.dNTP的大量消耗 C.产物的聚集 D.非特异性产物的竞争性抑制 2.Clark作了一个有趣的实验,发现TaqDNA聚合酶可以不需要模板,在双链DNA的末端加一个碱基,主要是加(B) A. dGTP B.dATP C.dCTP D.dTTP 3.有简并引物的3’端尽量使用具有简并密码的氨基酸,这是因为(A) A. TaqDNA聚合酶具有一定的不精确性 B.便于排除错误碱基的掺入 C.易于退火 D.易于重组连接 4.PCR实验的特异性主要取决于(C) A.DNA聚合酶的种类 B.反应体系中模板DNA的量 C.引物序列的结构和长度 D.四种dNTP的浓度 E.循环周期的次数 5.有关PCR的描述下列哪项不正确:(D) A.是一种酶促反应 B.引物决定了扩增的特异性 C.扩增的产量按Y m 1+X n D.扩增的对象是氨基酸序列 E.扩增的对象是DNA序列 6.有关PCR的描述下列哪项正确: ABC A.polymerase chain reaction的字首缩写 B.1993年获诺贝尔化学奖 C.已广泛的应用于医学各学科 D.能够准确对扩增模板定量 E.以上都对 7.PCR反应产物的特异性取决于 E A镁离子浓度 B退火温度 C引物碱基组成和长度 D循环次数 E.A+B+C 填空 1.Clark发现用TaqDNA聚合酶得到的PCR反应产物不是平末端,而是有一个突出碱基末端的双链DNA分子。根据这一发现设计了克隆PCR产物的 。 2.在简并引物的设计中,常常要用到dI(次黄嘌呤),原因是 。 3.简并引物PCR主要是根据蛋白质的氨基酸序列设计 引物来合成相应的基因。 4.SSC是由NaCl和柠檬酸钠组成的试剂,其中NaCl的作用是使 ,而柠檬酸钠的作用是 。 KEY 1.T-载体 2.dI可以和任何载体相匹配 3.一组混合 4.DNA溶解;作为螯合剂抑制核酸酶的活性 简答题 1.你打算扩增下图所示的两段序列之间的DNA,请从所列出引物中选出合适的一对, 5’-GACCTGTGGAAGC CATACGGGATTG-3’ 3’-CTGGACACCTTCG GTATGCCCTAAC-5’ 引物1 引物2 5’-GACCTGTGGAAGC 5’-CATACGGGATTG 5’-CTGGACACCTTCG 5’-GTATGCCCTAAC 5’-CGAAGGTGTCCAG 5’-GTTAGGGCATAC 5’-GCTTCCACAGGTC 5’-CAATCCCGTATG 答:引物1:5’-GACCTGTGGAAGC; 引物2:5’-CAATCCCGTATG 2.PCR反应包括引物与DNA模板链间的解链与复性。讨论循环温度范围对引物-DNA双螺旋稳定性的影响及对PCR产率的影响。 答:由于GC对间是三个氢键的作用力,比两个氢键作用力的AT对要稳定,因此DNA的解链与退火都是依赖于G+C的含量与A+T的含量的比例。GC对普遍比AT对更倾向于非特异性的复性,所以GC含量高的引物比AT含量高的引物更适合于PCR反应。 PCR的基本原理是什麽?用PCR扩增某一基因,必须预先得到什麽样的信息? (1) 利用DNA半保留复制的原理,在体外进行DNA的变性、复性和引物延伸。 (2) 至少要预先知道足够合成一对引物的靶DNA序列。 3.何谓简并引物?简并引物设计的一般原则是什麽? 答:简并引物是指根据肽链的氨基酸序列(或部分序列),并充分考虑密码子的简并性而设计的,用于PCR扩增的混合引物之间具有不同的碱基组成,但碱基数量是相同的。由于充分考虑了密码的简并性,在这种混合引物中必定有一种引物可以和该基因的DNA序列精确互补。 简并引物设计的一般原则是: (1) 选择保守区设计简并引物; (2) 选择简并性低的氨基酸密码区设计引物; (3) 注意密码的偏爱性; (4) 使用尽可能短的引物,以降低简并性,最短可用15~20个碱基。 (5) 由于TaqDNA聚合酶在PCR扩增时容易掺入错误碱基,所以设计的引物,其3’端尽量使用具有简并密码的氨基酸。 4.在古生物学中,尚不知道恐龙是否是温血爬行动物,而不像今天的变温爬行动物。假如你得到一些恐龙的DNA,你如何通过PCR和基因克隆来检测恐龙是否是温血爬行动物? 答:用PCR扩增恐龙的高度保守的酶的基因,然后将扩增的DNA克隆到大肠杆菌表达载体,每可能被合成。然后测定酶的最适温度和热的稳定性并与相应的温血动物(如鸟类)进行比较。来自于冷血动物的酶与来自于温血动物的酶相比,温血动物最适的温度范围较宽。 5.PCR反应同大肠杆菌体内的DNA复制有哪些不同
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