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一 核酸
二核酸的化学成分
三 核酸的理化性质
四 DNA的一级结构
五 DNA的二级结构
六 DNA的高级结构
七基因与基因组;一 核酸;*转化实验
1928年,Griffith等人肺炎双球菌实验(图1-1);
1944年,Avery提出转化因子是DNA(图1-2)。
;;;噬菌体模式图;;;2 核酸的分类与分布;二 核酸的化学成分;嘧啶碱基;β-D-核糖 β-D-2-脱氧核糖;腺苷(AR) 脱氧胞苷(dCR);*核苷酸;*核酸;5'pApCpTpTpGpApApCpG3'DNA
5'pApCpUpUpGpApApCpG3'RNA;5’→3’;三 核酸的理化性质;*沉降速度:
RNA 环状DNA 开环、线状DNA;*核酸的紫外吸收
碱基、核苷、核苷酸和核酸在240~290nm的紫外波
段有强烈的光吸收,λmax=260nm
1 OD260dsDNA=50μg/ml
1 OD260ssDNA=33μg/ml
1 OD260 RNA=40μg/ml
纯DNA
A260/A280=1.8
纯RNA
A260/A280=2.0;*核酸的酸解和碱解
DNA和RNA对酸或碱的耐受程度有很大差别;*酶水解
核酸水解酶:水解磷酸二酯键。
DNA水解酶(DNases):以DNA为底物
RNA水解酶(RNases):以RNA为底物的。
核酸外切酶:从一端(3′-端或5′-端)开始
核酸内切酶:从中间开始;四 DNA的一级结构;;;DNA一级结构模式图;1)DNA结构的特点:;;2)DNA分子的多样性;五 DNA的二级结构;;;2、DNA双螺旋的稳定性;3、 DNA结构的多态性;DNA结构类型和螺旋参数; Z型:在DNA单链中存在嘌呤与嘧啶(CGCGCG或CACACA)交替排列的顺序时,就会出现左手双螺旋结构。在主链中各个磷酸根呈锯齿状排列,犹如“之”字形一样,因此叫做Z型沟象。;;不同螺旋形式DNA分子主要参数比较;;3)Z型DNA与生物的基因调控有关;B 远距离调控;六 DNA超螺旋结构;A:正超螺旋;B:环状双链DNA;C:负超螺旋;1、超螺旋特点;; 溴化乙锭(ethidium bromide, EB),通过嵌入到配对碱基之间的方式与DNA结合,导致DNA双螺旋的局部解旋(untwisting); CsCl密度梯度(含EB)离心:
超螺旋〉开环、线性
;; 环状DNA分子常以超螺旋结构存在,并以负超螺旋为主,有利于转录的起始。DNA超螺旋结构整体或局部的拓扑学变化及其调控对于DNA复制和RNA转录过程具有关键作用。
;七 核小体与染色体;核小体单位;3; H2A、H2B、H3和H4各两分子组成组蛋白八聚体,构成核心组蛋白,双螺旋DNA(146bp)以左手超螺旋的方式绕核心颗粒1.75 圈,缠绕在核心组蛋白表面,构成核心颗粒,两端各有11bp与H1结合,形成完整的核小体连接区DNA(平均55bp)将相邻的核小体连接。
;5;;其他非组蛋白:
HMC蛋白;
DNA结合蛋白;
A24非组蛋白.;;DNA (2nm, 200bp );;;八、基因与基因组;类型;2、基因组;3、 原核生物基因组; 基因组大小 编码蛋白质
乙肝病毒 3Kb 4种
痘病毒 3000Kb 几百种
大肠杆菌 4600Kb 3000-4000
;ΦX174:单链DNA病毒
编码11个蛋白质分子,总分子量为25万左右,相当于6078个核苷酸所容纳的信息量,但其DNA本身只有5375个核苷酸,最多能编码总分子量为20万的蛋白质分子,为解决这一矛盾,出现了基因重叠。;基因重叠的几种情况:
(1)完全重叠
(2)部分重叠
(3)两个基因只有一个碱基重叠
一个基因终止密码子的最后一个碱基是另一个基因
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